BLTM0211c Techniky molekulární biologie a genetiky - cvičení

Lékařská fakulta
jaro 2020
Rozsah
0/3/0. 45. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučující
MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (cvičící)
prof. MUDr. Anna Vašků, CSc. (přednášející)
Dipl. Ing. Martin Piskáček, Dr. rer. nat. (cvičící)
doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D., MBA (cvičící)
Mgr. Andrea Knight, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Bc. Tomáš Pruša (pomocník)
Garance
MUDr. Michal Jurajda, Ph.D.
Ústav patologické fyziologie – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Věra Ježková
Dodavatelské pracoviště: Ústav patologické fyziologie – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh
Pá 13:00–15:30 A18/208
Předpoklady
BLMB011c Molek. a buněč.biologie - cv.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět má posluchače vzdělat v základních principech analytických technik molekulární biologie a genetiky.
Výstupy z učení
Po absolutoriu kurzu jsou studenti schopni:
- popsat současné základní metody molekulární biologie a genetiky člověka:
- vysvětlí základní informace o genomu člověka a o možnostech jeho analýzy, o lidských chromosomech a vertikálním přenosu dědičnosti.
- ovládat praktické dovednosti týkající se cytogenetiky a klasické mendelovské genetiky člověka a základní metody molekulární genetiky.
Osnova
  • 1. Úvodní praktikum, základní matematické a statistické dovednosti v laboratoři. Informační zdroje pro molekulární biologii, databáze (Web of Science, Pubmed..), tvorba rešerší.
  • 2. Teorie zpracování biologického materiálu. Buffy coat
  • 3. Teorie izolace nukleových kyselin (základní pojmy, manipulace s DNA a RNA, měření koncentrace). PCR (princip metody) – nanodrop, spektrofotometr. Teorie ELFO
  • 4. PCR a agarózová elektroforéza produktů PCR, jejich detekce a kvantifikace, detekce populačně častých genových polymorfismů na úrovni DNA (PCR, agarosové elfo)
  • 5. Izolace RNA a kvantifikace pomocí real time PCR.
  • 6. Polyakrylamidová gelová elektroforéza – denaturační (SDS-PAGE). Princip metody a analýza elektroforegramů pomocí denzitometrie
  • 7. Western blotting a imunodetekce proteinů
  • 8. Analýza obrazu. Základy světelné mikroskopie , záznam obrazu z mikroskopu
  • 9. Využití a příprava monoklonálních protilátek
  • 10. Tkáňové kultury - metody buněčné a molekulární biologie a biochemie
  • 11. Flow cytometrie
  • 12. Sekvenování
  • 13. Enzymové markery a jejich stanovení
  • 14. Samostatná práce – referát na zadané téma z molekulární biologie a genetiky
Literatura
    neurčeno
  • ALBERTS, Bruce. Základy buněčné biologie :úvod do molekulární biologie buňky. 1. vyd. Ústí nad Labem: Espero, 1999, xxvi, 630. ISBN 80-902906-0-4. info
Výukové metody
praktické cvičení
Metody hodnocení
Podmínkou udělení zápočtu je absolvování výuky praktických cvičení maximálně s jednou absencí a odevzdání protokolů. Další případná průběžná kontrola znalostí (zkoušení, testy) je zcela v kompetenci asistentů, případně přednostky ústavu.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.