EMBC0321s Biochemie I - seminář

Lékařská fakulta
podzim 2023
Rozsah
0/4/0. 60. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (pomocník)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (pomocník)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (pomocník)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Jindra Smutná, Ph.D. (pomocník)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (pomocník)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh
Po 18. 9. až Pá 15. 12. Po 8:00–9:40 A16/213, St 20. 9. až Pá 15. 12. St 9:00–10:40 B11/327
Předpoklady
EMLC0111p Lékařská chemie - přednáška && EMBI0222s Biologie II - seminář || EMBI0222p Biologie II - přednáška
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu Biochemie I je procvičit základní metabolické pochody a dráhy probíhající na buněčné úrovni.
Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu bude student schopen:
- porozumět významu základních chemických pojmů a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a proteinů a jejich návaznosti.
- rozumět principům získávání, využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
- porozumět funkci buněčných membrán a principu kompartmentace na buněčné úrovni a transportním procesům v membráně.
- znát syntézu proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy, porozumět vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
- znát funkci hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.
- pochopit principy některých chorob na molekulární úrovni.
Osnova
  • Úvod do biochemie. Elektrolyty, aktivita iontů, osmolarita, osmolalita, tonicita, onkotický tlak.
  • Acidobazické děje, slabé kyseliny/báze. Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
  • Vlastnosti organických sloučenin (alkoholy, aldehydy, ketony, kyseliny a jejich deriváty).
  • Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie. Makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
  • Enzymy – aktivita, enzymová kinetika, kinetické parametry enzymů, inhibice enzymů.
  • Kofaktory enzymů – základní rysy struktury, funkce, vztah k vitaminům.
  • Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxidační fosforylace.
  • Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk.
  • Glykolýza. Glukoneogeneze.
  • Metabolismus glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
  • Struktura a vlastnosti lipidů. Tenzidy. Buněčné membrány, membránový transport.
  • Lipidy ve výživě. Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin. Metabolismus ketolátek.
  • Syntéza, elongace a desaturace mastných kyselin.
  • Metabolismus cholesterolu. Metabolismus žlučových kyselin.
  • Metabolismus triacylglycerolů, fosfolipidů.
  • Lipoperoxidace. Eikosanoidy. Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku.
  • Struktura a funkce hemoglobinu
  • Struktura a vlastnosti aminokyselin, peptidů, proteinů. Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů.
  • Obecné rysy přeměny a aminokyselin. Syntéza močoviny.
  • Katabolismus aminokyselin. Syntéza neesenciálních aminokyselin, vratné přeměny.
  • Přeměny aminokyselin na specializované produkty. Syntéza hemu.
  • Struktura a význam bází/nukleotidů. Močová kyselina. Společné rysy biosyntézy nukleotidů.
  • Metabolismus purinových/pyrimidinových nukleotidů. Význam tetrahydrofolátu a vitaminu B12.
  • Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce, syntéza proteinů, posttranslační modifikace proteinů.
Literatura
    povinná literatura
  • Interaktivní osnova v IS MUNI.
  • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
  • TOMANDL, Josef, Jiří DOSTÁL, Hana PAULOVÁ a Eva TÁBORSKÁ. Základy lékařské chemie a biochemie. 5. dotisk 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2023, 212 s. ISBN 978-80-210-6973-2. info
    doporučená literatura
  • LIEBERMAN, Michael a Alisa PEET. Marks' basic medical biochemistry : a clinical approach. Illustrated by Matthew Chansky. 5th edition. Philadelphia: Wolters Kluwer, 2018, xii, 1051. ISBN 9781496387721. info
Výukové metody
Aktivní procvičování a diskuze.
Metody hodnocení
Zápočet. Podmínky pro udělení zápočtu:
1) absolvování všech seminářů a 2) splnění požadavků průběžných kontrol (testů).
Při nesplnění požadavků průběžných kontrol je nutno psát opravný test, který je možné jedenkrát opakovat. Opravný test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky.
Podrobné podmínky jsou zveřejněny ve Studijních materiálech /Interaktivní osnově předmětu.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2021, podzim 2022, podzim 2024.