F1BC1_16 Biochemie

Farmaceutická fakulta
podzim 2021
Rozsah
3/1/0. 6 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
Mgr. Marie Brázdová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Marek Petr, Ph.D. (přednášející)
Ing. Branislav Ruttkay-Nedecký, Dr. (přednášející)
PharmDr. Zuzana Soldánová (přednášející)
Mgr. Marie Brázdová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marek Petr, Ph.D. (cvičící)
Ing. Branislav Ruttkay-Nedecký, Dr. (cvičící)
PharmDr. Zuzana Soldánová (cvičící)
Mgr. Magdaléna Drotárová (přednášející)
Mgr. Magdaléna Drotárová (cvičící)
Mgr. Tereza Mikešová (cvičící)
Mgr. Denis Šubert (cvičící)
Garance
Mgr. Marie Brázdová, Ph.D.
Ústav molekulární farmacie – Ústavy – Farmaceutická fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav molekulární farmacie – Ústavy – Farmaceutická fakulta
Rozvrh
Čt 13:00–15:30 45-135
  • Rozvrh seminárních/paralelních skupin:
F1BC1_16/01: Út 14. 9. 7:30–10:25 45-229, Út 12. 10. 7:30–10:25 45-229, Út 2. 11. 7:30–10:25 45-229, Út 23. 11. 7:30–10:25 45-229
F1BC1_16/02: Út 21. 9. 7:30–10:25 45-229, Út 19. 10. 7:30–10:25 45-229, Út 9. 11. 7:30–10:25 45-229, Út 30. 11. 7:30–10:25 45-229
F1BC1_16/03: Út 5. 10. 7:30–10:25 45-229, Út 26. 10. 7:30–10:25 45-229, Út 16. 11. 7:30–10:25 45-229, Út 7. 12. 7:30–10:25 45-229
F1BC1_16/04: Út 14. 9. 10:40–13:35 45-229, Út 12. 10. 10:40–13:35 45-229, Út 2. 11. 10:40–13:35 45-229, Út 23. 11. 10:40–13:35 45-229
F1BC1_16/05: Út 21. 9. 10:40–13:35 45-229, Út 19. 10. 10:40–13:35 45-229, Út 9. 11. 10:40–13:35 45-229, Út 30. 11. 10:40–13:35 45-229
F1BC1_16/06: Út 5. 10. 10:40–13:35 45-229, Út 26. 10. 10:40–13:35 45-229, Út 16. 11. 10:40–13:35 45-229, Út 7. 12. 10:40–13:35 45-229
Předpoklady
FAKULTA(FaF) || OBOR(MUSFaF)
Zvládnutí učiva v rozsahu přednášek.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Biochemie jako vědní disciplina a obor se rozvíjí rychlým tempem. Obsahově se zabývá metabolickými přeměnami esenciálních živin potravy, přeměnami biomolekul vzniklými vlastním metabolismem tělesných buněk zdravého organismu. Cílem předmětu "Biochemie" pro studenty Farmaceutické fakulty je osvojit si a pochopit základní metabolické dráhy probíhající v prostoru a čase, spojené se ziskem energie a podléhající regulačním interakcím.
Výstupy z učení
Základní znalosti z biochemie tvořící základ pro navazující předměty Metody molekulární biologie, Biotechnologie léčiv, Cvičení z biotechnologie léčiv, Farmakogenomika, Struktura a evoluce genomů
Osnova
  • Sylabus přednášek z BIOCHEMIE pro studenty FaF
    podzimní semestr - 2. ročník
    1. Biochemie: úvod
    Základy biochemie, živé systémy, prokaryotická/eukaryotická buňka, živočišná/rostlinná buňka, organely, chemické reakce, slabé interakce, voda médiem života, pH, pKa, pufrovací systémy, osmotický tlak, anorganické látky v organismu
    2. Struktura a funkce proteinů
    Aminokyseliny, peptidy, struktura a funkce proteinů, hemoglobin a myoglobin
    3. Enzymy
    Vlastnosti enzymů, klasifikace enzymů, kofaktory, katalýza, kinetika enzymových reakcí, enzymy v terapii
    4. Biologické membrány a membránový transport
    Membrány - složení, vlastnosti, druhy membránového transportu
    5. Bioenergetika a metabolismus sacharidů
    Obecná charakteristika, mono, di, polysacharidy, glykosaminoglykany, proteoglykany, lektiny, metabolismus, makroergní sloučeniny, transport glukózy, metabolismus glukózy glykolýza, přeměny pyruvátu, glukoneogeneze, glykogen syntéza a odbourávání, glykogenózy, pentosofosfátová dráha, metabolismus fruktosy, galaktosy, kyselina askorbová
    6. Metabolismus aminokyselin
    Degradace proteinů, zdroje bílkovin, katabolismus aminokyselin, syntéza neesenciálních aminokyselin, přeměny uhlíkatého skeletu aminokyselin
    7. Lipidy a metabolismus lipidů
    Typy lipidů a metabolismus obecně, transport lipidů, mastných kyselin, metabolismus mastných kyselin (ß-oxidace a syntéza), ketolátky, syntéza triacylglycerolů, fosfolipidů, sfingolipidy, peroxidace lipidů
    8. Metabolismus cholesterolu a ikosanoidy
    Syntéza, transport a vylučování cholesterolu, dělení steroidů, ikosanoidy (charakteristika a syntéza)
    9. Aerobní metabolismus
    Citrátový cyklus: acetyl CoA, dekarboxylace pyruvátu, reakce citrátového cyklu, regulace citrát. cyklu, anaplerotické reakce
    10. Dýchací řetězec, reaktivní formy kyslíku: transformace energie, aerobní fosforylace, NADH + H+, FADH2, přenašečové mechanismy (člunky), kofaktory dýchacího řetězce, enzymové komplexy dýchacího řetězce, syntéza ATP, reaktivní formy kyslíku, antioxidanty
    11. Nukleové kyseliny
    Základní charakteristika, struktura, rozdíly DNA/RNA, biosyntéza a odbourávání purinových a pyrimidinových nukleotidů, poruchy metabolismu purinů, replikace, transkripce, translace, genetický kód, mutace, glykosylace proteinů, regulace genové exprese
    12. Biochemie extracelulární a intracelulární komunikace
    Regulace metabolismu, nervová buňka, meziorgánové vztahy, biotransformace
    Cvičení č. 1: Stanovení koncentrace glukosy pomocí spektrofotometrické metody a diagnostických proužků.
    Cvičení č. 2: Spektrofotometrické stanovení koncentrace hořčíku pomocí metody kalibrační přímky.
    Cvičení č. 3: Chromatografické, elektroforetické a spektrální metody pro stadium vlastností nukleových kyselin a bílkovin.
    Cvičení č. 4. Stanovení katalytické koncentrace laktát dehydrogenasy. Kinetika enzymových reakcí.


    Přednášející:
    Mgr. Marie Brázdová, Ph.D.,
    Cvičící:
    Mgr. Magdalena Drotárová
    Mgr. Marek Petr
    Mgr. Zuzana Soldánová
    Dr.Ing. Branislav Ruttkay-Nedecký
    Mgr. Marie BRÁZDOVÁ, Ph.D.
    Garant discipliny:
    Mgr. Marie Brázdová, PhD.
Literatura
    povinná literatura
  • Josef Tomandl, Eva Táborská a kolektiv. Biochemie I : semináře. Brno, 2012. ISBN 978-80-210-5740-1. info
    doporučená literatura
  • MURRAY,R.K., GRANNER,D.K.,RODWELL,V.W. Harper´s Illustrated Biochemistry. Appleton & Lange, 2006. ISBN 07-147885-X. info
  • Robert K. Murray, Daryl K. Granner, Peter A. Mayes, Victor W. Ro. Harperova biochemie. ČR, 2002. ISBN 80-7319-013-3. info
  • CHAMPE,P.C.,HARVEY,R.A. Lippincott´s Illustrated Reviews: Biochemistry. Lippincott Wiliams & Wilkins, 1994. ISBN 0-397-51091-8. info
  • MURRAY,R.K., GRANNER,D.K.,MAYES,P.A.,RODWELL,V.W. Harperova biochemie (český překlad). Nakladatelství a vydavatelství H & H, 1993. ISBN 80-85787-38-5. info
  • APPS,D.K.,COHEN,B.B.,STEEL,C.M. Biochemistry (A concise text for medical students). Bailliére Tindall, 1992. ISBN 70-20-1444-3. info
Výukové metody
přednášky, teoretická příprava, laboratorní cvičení, domácí úkoly,
Metody hodnocení
Úspěšné zakončení předmětu písemnou a ústní zkouškou. Známka se odvíjí především od písemné části, kterou tvoří test s 40 otázek , 150 bodů. Pro úspěšné absolvování předmětu nutné zvládnout test na 60%. Předpokladem pro udělení zkoušky je získání zápočtu, pro získání zápočtu z předmětu " BIOCHEMIE" je nutné absolvování všech praktických cvičení, absolvování zápočtového testu na 80%, odpovídající znalosti biochemické problematiky a správné vypracování všech protokolů do cvičení. Zároveň před každým cvičením bude prováděn krátký test připravenosti na úlohu. V průběhu studia je povinné splnění 4 testů z základních biochemických drah. Dále skupinový úkol vypracování 2 kapitol seminářů. Písemný zkouškový test je vypracován na základě přednášek a otázek z Seminářů- viz doporučená literatura. Náhradu výuky pak vykoná v době a způsobem určeným příslušným vyučujícím. Při neudělení zápočtu student/ka vykoná zápočtové řízení v termínu, který určuje příslušný učitel praktické výuky. V případě, že předepsaným ukončením předmětu je pouze zápočet , je počet termínů pro jeho získání identický, jako kdyby byl předmět zakončen zkouškou.
Informace učitele
Požadavky na studenta
Úspěšné zakončení předmětu písemnou a ústní zkouškou. Známka se odvíjí především od písebmé části, kterou tvoří test. Pro úspěšné absolvování předměnu nutné zvládnout test na 60%.
Požadavky na připravenost studenta k praktické výuce, podmínky udělení zápočtu.
Studenti jsou povinni v průběhu výuky v semestru prokazovat připravenost na praktickou výuku podle požadavků stanovených vedoucím discipliny na počátku semestru.
Předpokladem pro udělení zápočtu z předmětu " BIOCHEMIE" je absolvování všech praktických cvičení, odpovídající znalosti biochemické problematiky a správné vypracování všech protokolů do cvičení .
Zároveň před každým cvičením bude prováděn krátký test připravenosti na úlohu. V průběhu studia je povinné splnění 4 testů z základních biochemických drah.
Písemný test je vypracován na základě přednášek a otázek z Seminářů- viz doporučená literatura.
V případě nekvalitní přípravy bude student/ka ze cvičení vyloučen/a, neboť by mohl/a bezprostředně ohrozit chod cvičení ev. způsobit újmu na zdraví kteréhokoliv z účastníků praktické výuky. Náhradu výuky pak vykoná v době a způsobem určeným příslušným vyučujícím.
Při neudělení zápočtu student/ka vykoná zápočtové řízení v termínu, který určuje příslušný učitel praktické výuky. V případě, že předepsaným ukončením předmětu je pouze zápočet (zimní semestr), je počet termínů pro jeho získání identický, jako kdyby byl předmět zakončen zkouškou.
Absence v praktické výuce musí student/ka doložit hodnověrnými doklady.
Za odbornou náplň praktických cvičení z biochemie odpovídá
Materiálové zabezpečení a provoz praktických cvičení zajišťuje garant disciplíny.

Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2020, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.