Informace o předmětu

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (přednášející)
Ing. Sylva Koudelková, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Enzymy v molekulární biologii.
• 5. Polymerázová řetězcová reakce.
• 6. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 7. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 8. Klonovací strategie, přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách.
• 9. Principy molekulární diagnostiky.
• 10. Průtoková cytometrie.
• 11. Transkripce a translace in vitro.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza, hmotnostní spektrometrie, sekvenování.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami.
• 15. Analýza metylace DNA a postranslačních modifikací proteinů.
• 16. Editace genomové DNA a RNA interference.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (přednášející)
Ing. Sylva Koudelková, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 19. 2. až Ne 26. 5. Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Enzymy v molekulární biologii.
• 5. Polymerázová řetězcová reakce.
• 6. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 7. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 8. Klonovací strategie, přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách.
• 9. Principy molekulární diagnostiky.
• 10. Průtoková cytometrie.
• 11. Transkripce a translace in vitro.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza, hmotnostní spektrometrie, sekvenování.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami.
• 15. Analýza metylace DNA a postranslačních modifikací proteinů.
• 16. Editace genomové DNA a RNA interference.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (přednášející)
Ing. Sylva Koudelková, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Enzymy v molekulární biologii.
• 5. Polymerázová řetězcová reakce.
• 6. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 7. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 8. Klonovací strategie, přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách.
• 9. Principy molekulární diagnostiky.
• 10. Průtoková cytometrie.
• 11. Transkripce a translace in vitro.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza, hmotnostní spektrometrie, sekvenování.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami.
• 15. Analýza metylace DNA a postranslačních modifikací proteinů.
• 16. Editace genomové DNA a RNA interference.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Enzymy v molekulární biologii.
• 5. Polymerázová řetězcová reakce.
• 6. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 7. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 8. Klonovací strategie, přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách.
• 9. Principy molekulární diagnostiky.
• 10. Průtoková cytometrie.
• 11. Transkripce a translace in vitro.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza, hmotnostní spektrometrie, sekvenování.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami.
• 15. Analýza metylace DNA a postranslačních modifikací proteinů.
• 16. Editace genomové DNA a RNA interference.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 1. 3. až Pá 14. 5. Út 10:00–12:50 online_B5

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Enzymy v molekulární biologii.
• 5. Polymerázová řetězcová reakce.
• 6. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 7. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 8. Klonovací strategie, přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách.
• 9. Principy molekulární diagnostiky.
• 10. Průtoková cytometrie.
• 11. Transkripce a translace in vitro.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza, hmotnostní spektrometrie, sekvenování.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami.
• 15. Analýza metylace DNA a postranslačních modifikací proteinů.
• 16. Editace genomové DNA a RNA interference.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Enzymy v molekulární biologii.
• 5. Polymerázová řetězcová reakce.
• 6. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 7. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 8. Klonovací strategie, přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách.
• 9. Principy molekulární diagnostiky.
• 10. Průtoková cytometrie.
• 11. Transkripce a translace in vitro.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza, hmotnostní spektrometrie, sekvenování.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami.
• 15. Analýza metylace DNA a postranslačních modifikací proteinů.
• 16. Editace genomové DNA a RNA interference.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lucia Knopfová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 18. 2. až Pá 17. 5. Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Antropobiologie a antropogenetika)

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lucia Knopfová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Antropobiologie a antropogenetika)

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Výstupy z učení

Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lucia Knopfová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 20. 2. až Po 22. 5. Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Antropobiologie a antropogenetika)

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lucia Knopfová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Antropobiologie a antropogenetika)

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lucia Knopfová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB, směr Antropogenetika)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 60 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB, směr Antropogenetika)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–12:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB, směr Antropogenetika)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 8:00–10:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Rozvrh

Út 8:00–10:50 B11/306

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Rozvrh

Čt 17:00–19:50 A,01026

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Rozvrh

Pá 8:00–10:50 BR3

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Rozvrh

Út 9:00–11:50 BR3

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Rozvrh

Út 10:00–12:50 BR3

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Rozvrh

Čt 9:00–11:50 BR1

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Rozvrh

Pá 8:00–10:50 B1,01004

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. Základy buněčné biologie. Espero Publishing. 1998.
• SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství

Informace učitele

http://orion.sci.muni.cz/kgmb/student/6400.htm
Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. Základy buněčné biologie. Espero Publishing. 1998.
• SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství

Informace učitele

http://orion.sci.muni.cz/kgmb/student/6400.htm
Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. Základy buněčné biologie. Espero Publishing. 1998.
• SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství

Informace učitele

http://orion.sci.muni.cz/kgmb/student/6400.htm
Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Buněčná a molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
• 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
• 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
• 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
• 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
• 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
• 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
• 8. Zakládání genových knihoven.
• 9. Průtoková cytometrie.
• 10. Transkripce a translace in vitro.
• 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
• 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
• 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
• 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

Bi6400 Metody molekulární biologie

Rozsah

3/0/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.

Předpoklady

SOUHLAS || Ex_3065 Molekulární biologie || Imp_9115 Molekulární biologie || B3120 Buněčná a molekulární biologie || B4030 Molekulární biologie || B5740 Molekulární biologie || B6130 Molekulární biologie || B7940 Molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a bílkovin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů metod a způsobů jejich praktického využití.

Osnova

• 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro. 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin. 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin. 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů. 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování. 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace. 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy. 8. Zakládání genových knihoven.9. Průtoková cytometrie. 10. Transkripce a translace in vitro. 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky. 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace. 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek. 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.

Literatura

• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Metody hodnocení

Zkouška se provádí formou písemného testu, po kterém následuje krátký ústní pohovor.

Navazující předměty

• Bi6405 Metody molekulární biologie - cvičení
• Bi8090 Genové inženýrství

Informace učitele

Požadavky na úspěšné ukončení přemětu: 1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.

Další komentáře

Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6126 Laboratorní praxe při práci s aDNA
  Bi6400&&Bi6400c  
• Bi6400c Metody molekulární biologie - cvičení
  (Ex_3065 || Imp_9115 || B3120 || B4030 || B5740 || B6130 || B7940 || B4020 || Bi4020 || Bi4035) && NOW(Bi6400) && !B6405  
• Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
  Bi1700 && (Bi4010 || Bi4020) && (Bi4020c || Bi6400)  
• Bi8090 Genové inženýrství
  Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400 || NOW(Bi6400) || souhlas  
• Bi8312 Praktikum z molekulární biologie virů
  Bi6400  
• Bi8313 Praktikum z genového inženýrství
  !B6492 && (Ex_2979 || Ex_2980 || B6390 || B6400 || Bi6400) && (Bi6405 || B6405 || Bi6400c) && NOW(Bi8090) && !Bi5491  

• Statistika zápisu (nejnovější)