Informace o předmětu

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně

Vyučující

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen především studentům navazujícího studijního programu Mikrobiologie, případně studentům jiných navazujících studijních programů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie (Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je seznámit studenty s principy vybraných molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod pro analýzu mikroorganismů, s postupem pro volbu vhodné metody pro řešení reálného problému,s rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky a s interpretací výsledků analýz. Studenti získají konkrétní informace o následujících procesech: 1) Izolace nukleových kyselin (NK) z mikroorganismů a analýza NK chromatografickými a elektromigračními metodami 2) Aplikace enzymů v analýze mikrobiálních genů 3) Sekvenční analýza mikrobiálních genů a genomů, sekvenace proteinů 4) Využití hybridizace a polymerázové řetězové reakce v mikrobiologii 5) Metody studia mikrobiálních proteinů a metabolitů 6) Využití rekombinantních NK při studiu mikroorganismů

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu by studenti měli být schopni: porozumět a vysvětlit principy základních molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod metod využívaných v mikrobiologii, navrhnout postup pro řešení skutečného problému, realizovat rozdíly v metodách používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
• Metody přípravy rekombinantních molekul DNA a RNA a jejich využití při studiu mikroorganismů

Literatura

doporučená literatura
• Persing D.H. a kol. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 3rd Edition. 2016, 835 p. ISBN: 978-1-555-81908-8
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• Brown T.A. Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, 8th Edition. 2020, Wiley-Blackwell, 432 p. ISBN: 978-1-119-64078-3
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá v případě příznivé epidemiologické situace prezenčně. Při výuce jsou používány powerpointové prezentace. Na předmět navazuje volitelné laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje minimálně 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně. Student musí zodpovědět správně alespoň 16 otázek (více jak 50% správných odpovědí). Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím. Následuje krátká diskuse s vyučujícím nad výsledky testu (ústní část zkoušky).

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 19. 2. až Ne 26. 5. St 13:00–14:50 E25/209

Předpoklady

Předmět je určen především studentům navazujícího studijního programu Mikrobiologie, případně studentům jiných navazujících studijních programů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie (Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je seznámit studenty s principy vybraných molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod pro analýzu mikroorganismů, s postupem pro volbu vhodné metody pro řešení reálného problému,s rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky a s interpretací výsledků analýz. Studenti získají konkrétní informace o následujících procesech: 1) Izolace nukleových kyselin (NK) z mikroorganismů a analýza NK chromatografickými a elektromigračními metodami 2) Aplikace enzymů v analýze mikrobiálních genů 3) Sekvenční analýza mikrobiálních genů a genomů, sekvenace proteinů 4) Využití hybridizace a polymerázové řetězové reakce v mikrobiologii 5) Metody studia mikrobiálních proteinů a metabolitů 6) Využití rekombinantních NK při studiu mikroorganismů

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu by studenti měli být schopni: porozumět a vysvětlit principy základních molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod metod využívaných v mikrobiologii, navrhnout postup pro řešení skutečného problému, realizovat rozdíly v metodách používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
• Metody přípravy rekombinantních molekul DNA a RNA a jejich využití při studiu mikroorganismů

Literatura

doporučená literatura
• Persing D.H. a kol. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 3rd Edition. 2016, 835 p. ISBN: 978-1-555-81908-8
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• Brown T.A. Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, 8th Edition. 2020, Wiley-Blackwell, 432 p. ISBN: 978-1-119-64078-3
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá v případě příznivé epidemiologické situace prezenčně. Při výuce jsou používány powerpointové prezentace. Na předmět navazuje volitelné laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje minimálně 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně. Student musí zodpovědět správně alespoň 16 otázek (více jak 50% správných odpovědí). Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím. Následuje krátká diskuse s vyučujícím nad výsledky testu (ústní část zkoušky).

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 13:00–14:50 E25/209

Předpoklady

Předmět je určen především studentům navazujícího studijního programu Mikrobiologie, případně studentům jiných navazujících studijních programů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie (Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je seznámit studenty s principy vybraných molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod pro analýzu mikroorganismů, s postupem pro volbu vhodné metody pro řešení reálného problému,s rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky a s interpretací výsledků analýz. Studenti získají konkrétní informace o následujících procesech: 1) Izolace nukleových kyselin (NK) z mikroorganismů a analýza NK chromatografickými a elektromigračními metodami 2) Aplikace enzymů v analýze mikrobiálních genů 3) Sekvenční analýza mikrobiálních genů a genomů, sekvenace proteinů 4) Využití hybridizace a polymerázové řetězové reakce v mikrobiologii 5) Metody studia mikrobiálních proteinů a metabolitů 6) Využití rekombinantních NK při studiu mikroorganismů

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu by studenti měli být schopni: porozumět a vysvětlit principy základních molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod metod využívaných v mikrobiologii, navrhnout postup pro řešení skutečného problému, realizovat rozdíly v metodách používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
• Metody přípravy rekombinantních molekul DNA a RNA a jejich využití při studiu mikroorganismů

Literatura

doporučená literatura
• Persing D.H. a kol. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 3rd Edition. 2016, 835 p. ISBN: 978-1-555-81908-8
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• Brown T.A. Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, 8th Edition. 2020, Wiley-Blackwell, 432 p. ISBN: 978-1-119-64078-3
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá v případě příznivé epidemiologické situace prezenčně. Při výuce jsou používány powerpointové prezentace. Na předmět navazuje volitelné laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje minimálně 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně. Student musí zodpovědět správně alespoň 16 otázek (více jak 50% správných odpovědí). Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím. Následuje krátká diskuse s vyučujícím nad výsledky testu (ústní část zkoušky).

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 13:00–14:50 E25/209

Předpoklady

Předmět je určen především studentům navazujícího studijního programu Mikrobiologie, případně studentům jiných navazujících studijních programů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie (Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je seznámit studenty s principy vybraných molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod pro analýzu mikroorganismů, s postupem pro volbu vhodné metody pro řešení reálného problému,s rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky a s interpretací výsledků analýz. Studenti získají konkrétní informace o následujících procesech: 1) Izolace nukleových kyselin (NK) z mikroorganismů a analýza NK chromatografickými a elektromigračními metodami 2) Aplikace enzymů v analýze mikrobiálních genů 3) Sekvenční analýza mikrobiálních genů a genomů, sekvenace proteinů 4) Využití hybridizace a polymerázové řetězové reakce v mikrobiologii 5) Metody studia mikrobiálních proteinů a metabolitů 6) Využití rekombinantních NK při studiu mikroorganismů

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu by studenti měli být schopni: porozumět a vysvětlit principy základních molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod metod využívaných v mikrobiologii, navrhnout postup pro řešení skutečného problému, realizovat rozdíly v metodách používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
• Metody přípravy rekombinantních molekul DNA a RNA a jejich využití při studiu mikroorganismů

Literatura

doporučená literatura
• Persing D.H. a kol. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 3rd Edition. 2016, 835 p. ISBN: 978-1-555-81908-8
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• Brown T.A. Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, 8th Edition. 2020, Wiley-Blackwell, 432 p. ISBN: 978-1-119-64078-3
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka probíhá v případě příznivé epidemiologické situace prezenčně. Při výuce jsou používány powerpointové prezentace. Na předmět navazuje volitelné laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje minimálně 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně. Student musí zodpovědět správně alespoň 16 otázek (více jak 50% správných odpovědí). Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím. Následuje krátká diskuse s vyučujícím nad výsledky testu (ústní část zkoušky).

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Martin Benešík, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 1. 3. až Pá 14. 5. Út 12:00–13:50 online_B1

Předpoklady

Předmět je určen především studentům navazujícího studijního programu Mikrobiologie, případně studentům jiných navazujících studijních programů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie (Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je seznámit studenty s principy vybraných molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod pro analýzu mikroorganismů, s postupem pro volbu vhodné metody pro řešení reálného problému,s rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky a s interpretací výsledků analýz. Studenti získají konkrétní informace o následujících procesech: 1) Izolace nukleových kyselin (NK) z mikroorganismů a analýza NK chromatografickými a elektromigračními metodami 2) Aplikace enzymů v analýze mikrobiálních genů 3) Sekvenční analýza mikrobiálních genů a genomů, sekvenace proteinů 4) Využití hybridizace a polymerázové řetězové reakce v mikrobiologii 5) Metody studia mikrobiálních proteinů a metabolitů 6) Využití rekombinantních NK při studiu mikroorganismů

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu by studenti měli být schopni: porozumět a vysvětlit principy základních molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod metod využívaných v mikrobiologii, navrhnout postup pro řešení skutečného problému, realizovat rozdíly v metodách používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
• Metody přípravy rekombinantních molekul DNA a RNA a jejich využití při studiu mikroorganismů

Literatura

doporučená literatura
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Výuka bude v jarním semestru 2021 probíhat on-line. Při výuce jsou používány powerpointové prezentace. Na předmět navazuje volitelné laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje minimálně 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně. Student musí zodpovědět správně alespoň 16 otázek (více jak 50% správných odpovědí). Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím. Následuje krátká diskuse s vyučujícím nad výsledky testu (ústní část zkoušky).

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 13:00–14:50 E25/209

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie (Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je seznámit studenty s principy vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod, s postupem pro volbu vhodné metody pro řešení reálného problému,s rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky a s interpretací výsledků analýz. Studenti získají konkrétní informace o následujících procesech: 1) Izolace nukleových kyselin (NK) z mikroorganismů a analýza NK chromatografickými a elektromigračními metodami 2) Aplikace enzymů v analýze mikrobiálních genů 3) Sekvenční analýza mikrobiálních genů 4) Využití hybridizace a polymerázové řetězové reakce v mikrobiologii 5) Metody studia mikrobiálních proteinů 6) Využití rekombinantních NK při studiu mikroorganismů

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu by studenti měli být schopni: porozumět a vysvětlit principy základních molekulárně biologických metod, biochemických a biofyzikálních metod využívaných v mikrobiologii, navrhnout postup pro řešení skutečného problému, realizovat rozdíly v metodách používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
• Metody přípravy rekombinantních molekul DNA a RNA a jejich využití při studiu mikroorganismů

Literatura

doporučená literatura
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány powerpointové prezentace. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně. Student musí zodpovědět správně 15 otázek (50%). Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím. Následuje krátká diskuse s vyučujícím nad výsledky testu (ústní část zkoušky).

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 18. 2. až Pá 17. 5. St 13:00–14:50 E25/209

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z předmětu  Molekulární biologie (Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Studenti budou seznámeni s principy vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod a vhodnosti jejich využití pro různé typy mikroorganismů.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; uvědomit si rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
• Bioinfomratické nástroje v analýze mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány powerpointové prezentace. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (přednášející), Mgr. Iva Buriánková, Ph.D. (zástupce)

Garance

Mgr. Iva Buriánková, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Iva Buriánková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 13:00–14:50 E25/209

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Studenti budou seznámeni s principy vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod a vhodnosti jejich využití pro různé typy mikroorganismů.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; uvědomit si rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (přednášející), prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc. (zástupce)

Garance

prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 20. 2. až Po 22. 5. Po 15:00–16:50 E25/209

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; uvědomit si rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (přednášející), prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc. (zástupce)
Mgr. Jana Čmielová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 14:00–15:50 E25/209

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; uvědomit si rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (přednášející), prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc. (zástupce)

Garance

prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 15:00–16:50 E25/209

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; uvědomit si rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (přednášející), prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc. (zástupce)
Mgr. Jana Čmielová, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 14:00–15:50 E25/209

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; uvědomit si rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Izolace DNA a mtDNA z kvasinek.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (přednášející), prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc. (zástupce)
Mgr. Jana Čmielová, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Eva Šebestová, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 14:00–15:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

povinná literatura
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

doporučená literatura
• Molecular microbiology : diagnostic principles and practice. Edited by David H. Persing. 2nd ed. Washington, DC: ASM Press, 2011, xvi, 936. ISBN 9781555814977. info
• ROLFS, A. PCR :clinical diagnostics and research. Berlin: Springer-Verlag, 1992, xix, 271 s. ISBN 3-540-55440-8. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace v PowerPoint. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Rozvrh

Út 10:00–11:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Rozvrh

Út 10:00–11:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Rozvrh

Po 12:00–13:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody využívané při analýze mikroorganismů. Fragmentace isolovaných molekul DNA restrikčními enzymy. Metody používané při analýze nukleových kyselin (elektromigrační metody, chromatografické metod, spektrofotometrické metody, sekvencování). Hybridizace nukleových kyselin. Průběh a provedení polymerázové řetězové reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Mikrobiální metabolity a jejich chromatografické stanovení. Chemotaxonomie a stanovení složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Techniky s využitím imunomagnetické a afinitní separace. K přednášce patří cvičení Bi6721c.
Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen zkouškou.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Rozvrh

Út 12:00–13:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separarční techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.

Metody hodnocení

Součástí předmětu jsou laboratorní cvičení. Předmět je ukončen zkouškou, laboratorní cvičení zápočtem.

Navazující předměty

• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Rozvrh

Út 15:00–16:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separarční techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.

Metody hodnocení

Součástí předmětu jsou laboratorní cvičení. Předmět je ukončen zkouškou, laboratorní cvičení zápočtem.

Navazující předměty

• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Rozvrh

Út 10:00–11:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separarční techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.

Metody hodnocení

Součástí předmětu jsou laboratorní cvičení. Předmět je ukončen zkouškou, laboratorní cvičení zápočtem.

Navazující předměty

• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Rozvrh

Út 13:00–14:50 Bpt,01013

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separarční techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.

Metody hodnocení

Součástí předmětu jsou laboratorní cvičení. Předmět je ukončen zkouškou, laboratorní cvičení zápočtem.

Navazující předměty

• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separarční techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.

Metody hodnocení

Součástí předmětu jsou laboratorní cvičení. Předmět je ukončen zkouškou, laboratorní cvičení zápočtem.

Navazující předměty

• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separarční techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.

Metody hodnocení

Součástí předmětu jsou laboratorní cvičení. Předmět je ukončen zkouškou, laboratorní cvičení zápočtem.

Navazující předměty

• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Předmět se v období jaro 2012 nevypisuje.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
• Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
• Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
• Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
• Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
• Hybridizace.
• Polymerázová řetězová reakce (PCR).
• Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
• Principy kvantitativní analýzy.
• Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

doporučená literatura
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.

Metody hodnocení

Výuka je ukončena testem. Test obsahuje 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně.Student musí odpovědět správně 20 otázek. Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím.

Navazující předměty

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.

Předpoklady

Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.

Osnova

• Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin. Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy. Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod. Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin. Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin. Hybridizace. Polymerázová řetězová reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Imunomagnetické a afinitní separarční techniky v diagnostice mikroorganismů.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
• Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
• 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.

Metody hodnocení

Součástí předmětu jsou laboratorní cvičení. Předmět je ukončen zkouškou, laboratorní cvičení zápočtem.

Navazující předměty

• Bi7430 Molekulární biotechnologie
• Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení
• Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů

• Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů - cvičení
  NOW(Bi6721)  

• Statistika zápisu (nejnovější)