PřF:C7301 Genomika - cvičení - Informace o předmětu
C7301 Základy genomiky - cvičení
Přírodovědecká fakultapodzim 2024
- Rozsah
- 0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: z.
- Vyučující
- doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Ing. Eliška Kadlecová (cvičící)
Mgr. Jiří Rudolf (cvičící)
Mgr. Anna Rudolfová (cvičící)
RNDr. Jan Skalák, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lucia Tomovičová (cvičící) - Garance
- doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- NOW ( C7201 Genomika ) || NOW ( CG020 Genomika )
Předpokladem pro porozumění předmětu je absolvování základů biochemie nebo molekulární biologie a genetiky. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 4/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Jiné omezení: pro zápis do cvičení je nutné absolvování teoretické přednášky Bi7201 - Mateřské obory/plány
- předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Studenti získají praktické zkušenosti se základními metodami funkční genomiky, t.j. především metody identifikace inzerčních mutantů pomocí PCR: Od navržení primeru, jejich přípravy pomocí syntézy DNA, provedení vlastní PCR reakce, identifikace PCR produktů na gelu a potvrzení specificitry produktů pomocí Southern blot a hybridizace se značenou sondou až po fragmentační analýzu na automatickém sekvenátoru. Práce probíhá ve skupinách po 2 a každý si tak může prakticky vyzkoušet samostatný přístup jak k plánování experimentu, tak i jeho provedení.
- Výstupy z učení
- Na konci tohoto kurzu získají studenti přehled o základních přístupech funkční genomiky, které budou schopni využít při řešení problémů vlastní odborné praxe.
- Osnova
- Design sekvence oligonukleotidů
- Syntéza oligonukleotidů
- Analýza genové exprese pomocí transkripční fůze
- Izolace rostlinné genomové DNA
- Identifikace inzerčního mutanta pomocí PCR
- Práce s databázemi molekulárně-biologických informací
- Přenos DNA na membránu, příprava značené sondy a hybridizace
- Detekce hybridizované sondy
- Fragmentační analýza
- Literatura
- Výukové metody
- Praktické řešení problémů demonstrujících využití základních nástrojů funkční genomiky.
- Metody hodnocení
- Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Výuka předmětu bude prob9hat blokově, zpravidla v zápočtovém týdnu, přesný datum konání bude upřesněn během semestru.
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/C7301