PřF:C7895 Hmotnostní spektrometrie - Informace o předmětu
C7895 Hmotnostní spektrometrie biomolekul
Přírodovědecká fakultapodzim 2024
- Rozsah
- 2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
- Vyučující
- prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D.
Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- Znalost analytické chemie na úrovni základní přednášky. Znalost fyziky na úrovni střední školy. Výuka probíhá liché roky česky, v sudé anglicky anebo dle dohody se studenty. Závěrečnou ústní zkoušku lze složit v českem nebo anglickém jazyce.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Analytická biochemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
- Analytická biochemie (program PřF, N-BCH)
- Analytická chemie (program PřF, N-CH)
- Cíle předmětu
- Student porozumí základům hmotnostní spektrometrie včetně ionizačních technik, hmotnostních analyzátorů, iontových detektorů a vybraných aplikací, např. ionizační metody MALDI a ESI, moderní hmotnostní analyzátory time-of-flight, iontové pasti a orbitrap, identifikace a kvantifikace proteinů.
- Výstupy z učení
- Student získá celkový přehled o moderní hmotnostní spektrometrii a jejích aplikacích.
- Osnova
- 1. Stručná historie hmotnostní spektrometrie: Přehled metod a instrumentace. Základní koncepty MS (rozlišení, citlivost).
- 2. Ionizační metody a metody zavádění vzorku: Ionizace elektronovým nárazem (EI). Chemická ionizace (CI). Doutnavý výboj. Indukčně vázané plazma (ICP). Ionizace rychlými atomy (FAB). Ionizace (SIMS). Thermospray (TSI). Elektrospray (ESI). Laserová Desorpce (LD). Plazmová Desorpce (PD). Laserová desorpce za účasti matrice (MALDI). Spojení separace a hmotnostní spektrometrie (on-line, off-line, čipy).
- 3. Hmotnostní spektrometry: Základy iontové optiky. Simulace pohybu iontů (Simion). Energetické analyzátory. Magnetický sektor. Quadrupólový analyzátor. Iontový cyklotron (FT-ICR-MS). Iontová past (IT). Lineární past (LT). Orbitrap. Time-of-Flight hmotnostní spektrometr (TOFMS). Kolizně indukovaná disociace (CID). Tandemová MS (MS/MS). Principy vakuové techniky. Detektory a detekční elektronika.
- 4. Aplikace MS: Proteiny a peptidy. Mapování peptidů, proteinové databáze. DNA. Sacharidy. Syntetické polymery.
- Literatura
- COTTER, Robert J. Time-of-Flight Mass Spectrometry: Instrumentation and applications in biological research. Washington, D.C.: American Chemical Society, 1997, 326 s. ISBN 0-8412-3474-4. info
- COLE, Richard B. Electrospray Ionization Mass Spectrometry: Fundamentals, Instrumentation & Applications. John Wiley & Sons, Inc., 1997, 577 s. ISBN 0-471-14564-5. info
- Výukové metody
- Přednášky a diskuse na závěr kurzu. Návštěva laboratoře hmotnostní spektrometrie, praktické ukázky hardware.
- Metody hodnocení
- Závěrečná ústní zkouška (česky nebo anglicky) prezenční formou. Zkouška se sestává ze 3 otázek z oblastí: 1. ionizační techniky, 2. hmotnostní analyzátory, 3. aplikace. K absolvování je nutné zodpovědět správně dotazy na 50%.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://bart.chemi.muni.cz/index.php/cs/teaching
Výchozím materiálem ke studiu je prezentace, která je studentům k dispozici i v elektronické podobě. / The primary study material consists of the presentation slides, which is available to students in electronic form. - Další komentáře
- Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/C7895