C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2025
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Danuše Fridrichová (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
CG090 Metody v proteomice ||NOW( CG090 Metody v proteomice )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 5/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 5/36
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem předmětu je prohloubit teoretické znalosti a získat praktické dovednosti v oblasti analýzy proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie, separace proteinů, přípravy rekombinantní DNA, expreese a purifikace rekombianntních proteinů a jejich funkční analýzy.
Výstupy z učení
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
  • Práce s proteinovými databázemi
  • Určení 3D konformace proteinů s podobnou sekvencí aminokyselin
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Praktikum bude vyučováno blokově, pokud nebude oznámeno jinak, pak vždy v zápočtovém týdnu daného semestru.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Ing. Renata Holánková (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
CG090 Metody v proteomice ||NOW( CG090 Metody v proteomice )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 14/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem předmětu je prohloubit teoretické znalosti a získat praktické dovednosti v oblasti analýzy proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie, separace proteinů, přípravy rekombinantní DNA, expreese a purifikace rekombianntních proteinů a jejich funkční analýzy.
Výstupy z učení
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
  • Práce s proteinovými databázemi
  • Určení 3D konformace proteinů s podobnou sekvencí aminokyselin
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Praktikum bude vyučováno blokově, pokud nebude oznámeno jinak, pak vždy v zápočtovém týdnu daného semestru.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2023
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Danuše Fridrichová (cvičící)
Ing. Eliška Kadlecová (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Kateřina Konečná (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
CG090 Metody v proteomice ||NOW( CG090 Metody v proteomice )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 2/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem předmětu je prohloubit teoretické znalosti a získat praktické dovednosti v oblasti analýzy proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie, separace proteinů, přípravy rekombinantní DNA, expreese a purifikace rekombianntních proteinů a jejich funkční analýzy.
Výstupy z učení
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
  • Práce s proteinovými databázemi
  • Určení 3D konformace proteinů s podobnou sekvencí aminokyselin
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Praktikum bude vyučováno blokově, pokud nebude oznámeno jinak, pak vždy v zápočtovém týdnu daného semestru.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2022
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Danuše Fridrichová (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
CG090 Metody v proteomice ||NOW( CG090 Metody v proteomice )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 1/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem předmětu je prohloubit teoretické znalosti a získat praktické dovednosti v oblasti analýzy proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie, separace proteinů, přípravy rekombinantní DNA, expreese a purifikace rekombianntních proteinů a jejich funkční analýzy.
Výstupy z učení
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, přípravy proteinů pomocí různých technik, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
  • Práce s proteinovými databázemi
  • Určení 3D konformace proteinů s podobnou sekvencí aminokyselin
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Praktikum bude vyučováno blokově, pokud nebude oznámeno jinak, pak vždy v zápočtovém týdnu daného semestru.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Danuše Fridrichová (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Ing. Eliška Kadlecová (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (pomocník)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lucia Tomovičová (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
CG090 Metody v proteomice ||NOW( CG090 Metody v proteomice )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem předmětu je prohloubit teoretické znalosti a získat praktické dovednosti v oblasti analýzy proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie, separace proteinů, přípravy rekombinantní DNA, expreese a purifikace rekombianntních proteinů a jejich funkční analýzy.
Výstupy z učení
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2020
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Danuše Fridrichová (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (pomocník)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc. (cvičící)
Ing. Eliška Kadlecová (pomocník)
Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
CG090 Metody v proteomice ||NOW( CG090 Metody v proteomice )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem předmětu je prohloubit teoretické znalosti a získat praktické dovednosti v oblasti analýzy proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie, separace proteinů, přípravy rekombinantní DNA, expreese a purifikace rekombianntních proteinů a jejich funkční analýzy.
Výstupy z učení
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Výuka v semestru jaro 2020 bude probíhat blokově v termínu 18.5. – 30.9.2020. Sledujte IS a e-mail, kde se dozvíte více.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2019
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
Danuše Fridrichová (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (pomocník)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
C8202 Základy proteomiky || CG080 Genomika a proteomika ||NOW( C8202 Základy proteomiky )||NOW( CG080 Genomika a proteomika )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Cvičení bude probíhat blokově, 1. běh proběhne v termínu 18.-22.5., druhý běh pak od 25.-29.5. 2009.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2018
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Šárka Michlíčková (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Bc. Martina Válková (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
C8202 Základy proteomiky || CG080 Genomika a proteomika ||NOW( C8202 Základy proteomiky )||NOW( CG080 Genomika a proteomika )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Cvičení bude probíhat blokově, 1. běh proběhne v termínu 18.-22.5., druhý běh pak od 25.-29.5. 2009.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2017
Rozsah
0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (pomocník)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Šárka Michlíčková (pomocník)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Bc. Martina Válková (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
C8302/Beh_01: Rozvrh nebyl do ISu vložen.
C8302/Beh_02: Rozvrh nebyl do ISu vložen.
Předpoklady
C8202 Základy proteomiky || CG080 Genomika a proteomika ||NOW( C8202 Základy proteomiky )||NOW( CG080 Genomika a proteomika )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Cvičení bude probíhat blokově, 1. běh proběhne v termínu 18.-22.5., druhý běh pak od 25.-29.5. 2009.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2016
Rozsah
0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
Philip Anthony P. Jackson, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (pomocník)
Ing. Šárka Michlíčková (pomocník)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc. (cvičící)
Bc. Martina Válková (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
C8202 Základy proteomiky || CG080 Genomika a proteomika ||NOW( C8202 Základy proteomiky )||NOW( CG080 Genomika a proteomika )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Cvičení bude probíhat blokově, 1. běh proběhne v termínu 18.-22.5., druhý běh pak od 25.-29.5. 2009.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2015
Rozsah
0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Šárka Michlíčková (cvičící)
Bc. Martina Válková (cvičící)
Philip Anthony P. Jackson, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
C8302/C8302_beh_01: Rozvrh nebyl do ISu vložen. J. Hejátko, P. Jackson, H. Konečná, G. Lochmanová, Š. Michlíčková, A. Szmitkowska, M. Válková, Z. Zdráhal
C8302/C8302_beh_02: Rozvrh nebyl do ISu vložen. J. Hejátko, P. Jackson, H. Konečná, G. Lochmanová, Š. Michlíčková, A. Szmitkowska, M. Válková, Z. Zdráhal
Předpoklady
C8202 Základy proteomiky || CG080 Genomika a proteomika ||NOW( C8202 Základy proteomiky )||NOW( CG080 Genomika a proteomika )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Cvičení bude probíhat blokově, 1. běh proběhne v termínu 18.-22.5., druhý běh pak od 25.-29.5. 2009.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2014
Rozsah
0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: kz, z.
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Bc. Martina Válková (cvičící)
Mgr. Zuzana Gelová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Matej Zábrady, Ph.D. (cvičící)
Ing. Šárka Michlíčková (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
C8302/C8302_Beh_01: Rozvrh nebyl do ISu vložen. R. Dopitová, Z. Gelová, J. Hejátko, T. Klumpler, H. Konečná, G. Lochmanová, Š. Michlíčková, M. Válková, M. Zábrady, Z. Zdráhal
C8302/C8302_Beh_02: Rozvrh nebyl do ISu vložen. R. Dopitová, Z. Gelová, J. Hejátko, T. Klumpler, H. Konečná, G. Lochmanová, Š. Michlíčková, M. Válková, M. Zábrady, Z. Zdráhal
Předpoklady
C8202 Základy proteomiky || CG010 Proteomika ||NOW( C8202 Základy proteomiky )||NOW( CG010 Proteomika )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Po absolvování kurzu bude student schopen porozumět základním přístupům proteomiky z oblasti studia strukturních a funkčních vlastností proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separaci proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a bude schopen porozumět principům základní techniky hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Cvičení bude probíhat blokově, 1. běh v termínu od 19.-23.5., 2. běh 26.-30.5. 2014, detaily viz výukové materiály předmětu.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

C8302 Základy proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2013
Rozsah
0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Šárka Michlíčková (pomocník)
Bc. Martina Válková (cvičící)
Mgr. Zuzana Gelová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Matej Zábrady, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
C8302/C8302_01: Rozvrh nebyl do ISu vložen. J. Hejátko, H. Konečná, G. Lochmanová, Z. Zdráhal
C8302/C8302_02: Rozvrh nebyl do ISu vložen.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Hlavní cíle kurzu jsou porozumění základním přístupům proteomiky, t.j. strukturní a funkční studium proteinů pomocí technologie rekombinatních proteinů, separace proteinů pomocí různých technik, zejména dvourozměrné elektroforézy a kapalinové chromatografie, a porozumění základním technikám hmotnostní spektrometrie proteinů. Studenti budou schopni praktické aplikace těchto přístupů při řešení současných problémů základního i aplikovaného výzkumu proteinů.
Osnova
  • Dvourozměrná elektroforéza proteinů
  • Hmotnostní spektrometrie proteinů (MALDI-TOF, LC-MS/MS, příprava a analýza vzorků, identifikace proteinů)
  • Příprava, izolace a sekvencae rekombinatní DNA
  • Exprese rekombinantní DNA v E. coli
  • Jedno- a vícekroková purifikace rekombinantních proteinů
  • Určení čistoty a analýza rekombinantních proteinů
  • Western bloting
Literatura
  • THIELLEMENT, Hervé. Plant proteomics : methods and protocols. Totowa, N.J.: Humana Press, 2007, xiii, 399. ISBN 9781597452274. info
  • LIEBLER, Daniel C. Introduction to proteomics : tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press, 2002, ix, 198 s. ISBN 0-89603-991-9. info
Výukové metody
Praktické řešení úloh demonstrujících využití základních nástrojů současné proteomiky.
Metody hodnocení
Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
Informace učitele
Cvičení bude probíhat blokově, 1. běh proběhne v termínu 18.-22.5., druhý běh pak od 25.-29.5. 2009.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.