PřF:E8601 Pokročilé stat metody - Informace o předmětu
E8601 Pokročilé statistické metody
Přírodovědecká fakultajaro 2025
- Rozsah
- 0/3/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně - Vyučující
- RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Michaela Cvanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lucie Kubínová (cvičící)
RNDr. Simona Littnerová, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. (přednášející) - Garance
- prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- Kurz základní biostatistiky - např. Bi5040 Biostatistika - základní kurz nebo Bi5045 Biostatistika pro matematickou biologii. Znalost základních statistických technik jednorozměrné analýzy dat, analýza rozptylu, korelační analýza, jednoduchá regresní analýza přímky.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Environmentální biomedicína (program PřF, N-ZPZ)
- Environmentální chemie a toxikologie (program PřF, N-ZPZ)
- Cíle předmětu
- Cílem předmětu je představit studentům oblast vícerozměrné analýzy biologických dat v přehledné formě zaměřené na základní principy, limitace a praktickou interpretaci vícerozměrných analýz. V průběhu kurzu budou studenti seznámeni s možnostmi popisu a vizualizace vícerozměrného souboru dat, základními metodami shlukové a ordinační analýzy a strategií vícerozměrného stochastického modelování.
- Výstupy z učení
- Student bude po absolvování předmětu schopen:
Korektně připravit datový soubor pro vícerozměrnou analýzu;
Popsat vícerozměrná data; Použít vícerozměrné statistické testy;
Vybrat vhodnou metriku podobnosti nebo vzdálenosti;
Spočítat a vizualizovat asociační matice;
Ovládat aplikaci a principy různých shlukovacích algoritmů;
Ovládat aplikaci a principy různých ordinačních metod;
Ovládat aplikaci a principy základních regresních metod, ANOVA a ROC analýzy;
Zvolit adekvátní metodu pro analýzu vícerozměrných dat na základě výhod a omezení jednotlivých dostupných metod;
Interpretovat výsledky vícerozměrné analýzy dat. - Osnova
- Smysl a cíle vícerozměrné analýzy dat a modelování – příklady užití vícerozměrných analýz, výhody a nevýhody vícerozměrné analýzy dat, datová matice a značení, tabulkové a grafické zpracování vícerozměrných dat.
- Maticový počet – operace s maticemi, inverzní matice, vlastní čísla a vektory.
- Vícerozměrná rozdělení pravděpodobnosti – náhodný vektor a jeho realizace, popisné statistiky, interval spolehlivosti, odlehlá pozorování.
- Vícerozměrné statistické testy – vícerozměrný t-test, vícerozměrná analýza rozptylu.
- Podobnosti a vzdálenosti ve vícerozměrném prostoru.
- Asociační matice – výpočet a vizualizace, popisná analýza, operace s asociačními maticemi (Mantelův test, MEANSIM, ANOSIM, regrese na asociačních maticích).
- Shluková analýza hierarchická – hierarchické aglomerativní shlukování, hierarchické divizivní shlukování.
- Shluková analýza nehierarchická a identifikace optimálního počtu shluků.
- Ordinační analýzy – principy redukce dimenzionality, selekce a extrakce proměnných.
- Ordinační analýzy – analýza hlavních komponent (PCA).
- Ordinační analýzy – korespondenční analýza (CA), mnohorozměrné škálování (MDS).
- Ordinační analýzy - diskriminační analýza.
- Základy stochastického modelování - ANOVA, lineární regrese, ROC analýza, logistická regrese, strategie regresního modelování.
- Ucelený souhrn aplikace vícerozměrných metod v analýze dat.
- Literatura
- LEGENDRE, Pierre a Louis LEGENDRE. Numerical ecology. 3rd engl. ed. Amsterdam: Elsevier, 2012, xvi, 990. ISBN 9780444538680. info
- BORCARD, Daniel, François GILLET a Pierre LEGENDRE. Numerical ecology with R. New York: Springer, 2011, xi, 306. ISBN 9781441979759. info
- ZAR, Jerrold H. Biostatistical analysis. 5th ed. Upper Saddle River, N.J.: Prentice Hall, 2010, xiii, 944. ISBN 9780131008465. info
- Výukové metody
- Teoretické přednášky doplněné komentovanými příklady a cvičením na počítačích, studenti jsou podporováni v kladení otázek týkajících se probírané látky.
- Metody hodnocení
- Předmět je ukončen písemnou zkouškou zaměřenou zejména na principy vícerozměrných metod, předpoklady výpočtů a jejich aplikaci a interpretaci.
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2025/E8601