C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Přírodovědecká fakulta
jaro 2004
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Jaromír Toušek, Dr. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Předpoklady
Familiarity with principles of quantum mechanics will be helpful but is not required.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
The course will provide introduction to modern NMR techniques which can be applied to extract structural information for small and mid-size biological macromolecules - peptides, proteins, DNA and RNA oligonucleotides. Experimental procedures and computational protocols for determination of three-dimensional structures and dynamics based on NMR data will be discussed.
Osnova
  • 1. Principles of NMR Spectroscopy I 2. Principles of NMR Spectroscopy II 3. Basic NMR Experiments 4. Protein Structure Determination I (basic strategy, sequential assignment, side-chain assignment) 5. Protein Structure Determination II (nuclear Overhauser efect and internuclear distances, three-bond scalar couplings and torsion angles, other spatial restraints) 6. Protein Structure Determination III (secondary structure determination, intermolecular complexes, large proteins and membrane proteins) 7. Nucleic Acid Structure Determination I 8. Nucleic Acid Structure Determination II 9. Structure Refinement Using Molecular Dynamics 10. Dynamics of Biomolecules I (dynamics of molecules and NMR relaxation, theory of relaxation) 11. Dynamics of Biomolecules II 12. Review
Literatura
  • CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info
Metody hodnocení
Oral examination
Vyučovací jazyk
Angličtina
Navazující předměty
Informace učitele
http://www.ncbr.chemi.muni.cz/~lzidek/C6770.html
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2000, jaro 2001, jaro 2002, jaro 2003, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.