PřF:C8800 Rtg strukturní analýza - Informace o předmětu

C8800 Rtg strukturní analýza

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Analytická chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Analytická chemie (program PřF, M-CH)
• Anorganická chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Anorganická chemie (program PřF, M-CH)
• Anorganická chemie (program PřF, N-CH)
• Biochemie (program PřF, M-CH)
• Fyzikální chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Fyzikální chemie (program PřF, M-CH)
• Chemie makromolekulárních látek (program PřF, D-CH) (2)
• Chemie odborná (program PřF, M-CH)
• Chemie životního prostředí (program PřF, D-CH) (2)
• Chemie životního prostředí (program PřF, M-CH)
• Makromolekulární chemie (program PřF, M-CH)
• Organická chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Organická chemie (program PřF, M-CH)

Cíle předmětu

Symetrie látek, bodové grupy, symetrie difrakčního obrazu, Laueho třídy, primitivní a Bravaisova buňka, prostorové grupy.
Difrakce rtg. záření, Thompson. rozptyl, interference rozptýlených vln, atomový a strukturní faktor, Braggova a Laueho rovnice, Ewald. koule, intenzita difraktovaného záření, Fourierova syntéza.
Difrakční experiment, zdroje rtg. záření, synchrotrony, detektory, difraktometry, kryokrystalografie. Indexace reflexí, integrální intenzita, redukce dat, Lorenzova, polarizační a absorpční korekce.
Fázový problém, Pattersonova funkce a Patterson. techniky. Pravděpodobnostní rozložení strukturních faktorů, přímé metody. R-faktory. Metoda nejm. čtverců. SHELXS a SHELXL.
Makromolekulární krystalizační techniky, metoda sedící a visící kapky, očkování. Metody řešení fázového problému u proteinů, metoda molekulárního přemístění, metody kovových derivátů (SIR, MIR, MIRAS), MAD a selenoproteiny. Mapy elektronové hustoty, Four. transformace, výstavba strukturního modelu. Zpřesňování makromolekulárního strukturního modelu, metoda nejm. čtverců a "constrains+restrains". Protein. krystalografie v "postgenomické" éře.
Krystalografické databáze.

Osnova

• Symetrie látek
• Interakce rtg. záření s látkou
• Difrakce na krystalu
• Zdroje a detektory rtg. záření
• Difraktometry
• Fázový problém
• Pattersonovské a přímé metody
• Upřesňování modelu, R-faktory, metoda nejmenších čtverců.
• Programy SHELXS a SHELXL
• Příprava proteinových krystalů
• Proteiny a metody kovových derivátů
• Upřesňování proteinových strukturních modelů
• Krystalografické databáze

Literatura

• MAREK, Jaromír a Z. TRÁVNÍČEK. Monokrystalová rentgenová strukturní analýza. první. Olomouc: Vydavatelství Univerzity Palackého, 2002, 169 s. nedělí se na edice. ISBN 80-244-0551-2. info
• GIACOVAZZO, C. Fundamentals of Crystallography. 1992. ISBN 0-19-855578-4. info

Metody hodnocení

ústní zkouška či kolokvium

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (jaro 2007, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2007/C8800