Bi7440 Vědecké výpočty v biologii a biomedicíně

Přírodovědecká fakulta
jaro 2010
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. RNDr. Jiří Hřebíček, CSc. (přednášející)
Mgr. Jaroslav Urbánek (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jiří Hřebíček, CSc.
Rozvrh
Po 10:00–11:50 G2,02003
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
V závěru kurzu jsou studenti získají: - přehled trendů v oblasti vědeckých výpočtů - přehled metod užívaných při vědeckých výpočtech v biologii a medicíně - zkušenosti ve využití superpočítačů při vědeckých výpočtech
Osnova
  • Základní terminologie (data, informace, znalost, nejistota, neurčitost, přibližnost, fuzzy množiny a fuzzy logika, počítač, software, hardware, komunikace, internet)
  • Vědecké výpočty a výpočetní věda (vědecké výpočty, počítačová simulace, klasifikace vědeckých výpočtů)
  • Stručná historie vědeckých výpočtů/výpočetní vědy (vývoj v zahraničí, vývoj v České republice)
  • Stručný přehled technologií pro vědecké výpočty v biologii a biomedicíně
  • Nejpoužívanější biologické databáze a formáty dat v bioinformatice
  • Vědecké výpočty v biomedicíně
  • Vědecké výpočty s využitím Maple
  • Umělá inteligence a inteligentní agenti
  • Dolování z dat
  • Strojové učení
Literatura
  • HŘEBÍČEK, Jiří, Walter GANDER, Stanislav BARTOŇ a Michal ŠKRDLA. New Maple solution of the generalized Leibniz problem. In Maple Conference 2006. Waterloo, Ontario, Kanada: Maplesoft, 2006, s. 120-128. ISBN 1-897310-13-7. info
  • GANDER, Walter a Jiří HŘEBÍČEK. Solving Problems in Scientific Computing Using Maple and MATLAB. čtvrté. Heidelberg: Springer, 2004, 476 s. Mathematics. ISBN 3-540-21127-6. URL info
Výukové metody
Přednášky doplněné domácí prací a prezentacemi studentů
Metody hodnocení
Výuka přemětu v semestru týdně dle rozvrhu. V průběhu semestru jsou vyžadovány jednoduché domácí práce. Přemět je ukončen ústní zkouškou.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2005, podzim 2006, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014.