Bi8960 Genetic codes

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011
Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: zk.
Vyučující
prof. Ing. Eduard Nikolajevič Trifonov, Ph.D. (přednášející), prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (zástupce)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Předpoklady
Basic knowledge of molecular biology.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
In addition to protein-coding message the nucleotide sequences carry instructions for DNA folding, transcription, translation framing, gene splicing, fast adaptation code, and many more (1, 2). Every sequence element belongs simultaneously to several different messages superimposed on one another. The codes of protein sequences are of this nature as well. Most prominent examples of the code overlapping and interaction will be considered. The course is based largely on the most recent publications. This includes the latest developments on the chromatin code and its interactions with other codes (3, 4). Ref. (2) is an extended summary of the course. References: 1. Trifonov, E. N., Sequence codes. In: "Encyclopedia of Molecular Biology", T. E. Creighton, Ed., John Wiley & Sons, Inc., New York, 1999, p. 2324-2326. 2. Trifonov, E. N., Codes of biosequences. In: The Codes of Life. The Rules of Macroevolution. Barbieri, M. (ed.). Springer. New York, in press. 3. Trifonov, E. N., Kogan, S., Cohanim, A. B. Latest on the nucleosome positioning sequence patterns. In "DNA Structure, Chromatin and Gene Expression" (Eds. R. Kiyama, M. Shimizu), Transworld Research Network, Trivandrum (India), pp 43-54 (2006). 4. F. Salih, B. Salih, E. N. Trifonov, Sequence-directed mapping of nucleosome positions, JBSD in press. Main objectives of the course include: Learning about different kinds of codes carried by DNA sequence; Understanding principles of different periodical codes hidden in DNA sequence; Understanding principles of DNA-directed nucleosome positioning;
Osnova
  • Periodical and aperiodical codes in DNA
  • DNA bending versus DNA curvature
  • Nucleosome positioning - DNA sequence patterns
  • Other codes in DNA and RNA sequences
Literatura
  • 1. Trifonov, E. N., Sequence codes. In:
  • 2. Trifonov, E. N., Codes of biosequences. In: The Codes of Life. The Rules of Macroevolution. Barbieri, M. (ed.). Springer. New York, in press.
  • FAJKUS, Jiří a Edward N. TRIFONOV. Columnar Packing of Telomeric Nucleosomes. Biochemical and Biophysical Research Communications. California: Academic Press, 2001, roč. 280, č. 4, s. 961-963. ISSN 0006-291X. info
Výukové metody
přednášky
Metody hodnocení
Lectures will be given in English within a period of 10 working days (2-4 hours per day). The course will be concluded by colloquium after the last lesson.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Navazující předměty
Informace učitele
Lectures will be given in English within a period of 10 working days (2-4 lessons per day). In spring 2009 this will be held in April. The course will be concluded by colloquium after the last lesson.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2012 - akreditace.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2011/Bi8960