Bi6901 Structural Biology - practice

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012 - akreditace

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
0/2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)
prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Andrea Fořtová, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Martina Pavlová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
The ability to communicate in English.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 25 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/25, pouze zareg.: 0/25, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/25
Jiné omezení: !The prerequisite of the possibility to sign in the course is participation on the scientific work in Loschmidt Laboratories.
Cíle předmětu
This practise will be organized in the small groups of students and will focus on structural biology. At the end of this course, the students will be able independently to design experiments, conduct measurements and interpret data. They will learn how to critically access and communicate the results. During the journal clubs, students will learn interesting news from the field.
Osnova
  • Prediction of Protein Structure and Function by Bioinformatics Tools
  • Computer-Assisted Design of Proteins with Optimized Catalytic Properties
  • Engineering and Evolution of Proteins, Expression and Purification
  • Functional and Structural Characterization of Proteins by Steady-State and Transient Kinetics, Circular Dichroism Spectroscopy and Microcalorimetry
Literatura
    doporučená literatura
  • DOBES, Petr, Jan KMUNÍČEK, Vladimír MIKEŠ a Jiří DAMBORSKÝ. Binding of Fatty Acids to b-Cryptogein: Quantitative Structure-Activity Relationships and Design of Selective Protein Mutants. Journal of Chemical Information and Modeling. USA, 2004, roč. 44-6, č. 44, s. 2126-2132. ISSN 1549-960X. URL info
  • DAMBORSKÝ, Jiří. A mechanistic approach to deriving Quantitative Structure-Activity Relationship models for microbial degradation of organic compounds. SAR and QSAR in Environmental Research. 1996, roč. 5, č. 1, s. 27-36. ISBN1029046. URL info
Výukové metody
The lecture is taught by interpretation of powerpointovým templates prepared according to textbooks, monographs and articles. Templates are shown during the lecture, the contents are explained and accompanied by teacher commentary.
Metody hodnocení
discussions, journal clubs
Vyučovací jazyk
Angličtina
Další komentáře
Předmět je vyučován každý semestr.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, jaro 2009, podzim 2009, jaro 2010, podzim 2010, jaro 2011, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, jaro 2013.