Bi9042 Analýza struktury chromatinu - praktikum

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012
Rozsah
0/2. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (cvičící)
Mgr. Eva Sýkorová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc. (cvičící)
Mgr. Eva Polanská (cvičící)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
NOW( Bi9041 Strukt. eukar. chromozomů )
Základní znalosti molekulární biologie a biochemie, paralelní nebo předchozí absolvování kursu Struktura a funkce euk. chromozomů, znalost předpisů o BOZP v laboratoři.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Kurs je praktickým cvičením k teoretickému kursu Struktura a funkce eukaryotických chromozomů (Bi9041). Cílem je, aby na základě absolvování kursu student získal praktickou zkušenost s metodami používanými při analýze struktury chromozomů a chromatinu.
Seznámit prakticky studenty s metodami přípravy buněč. jader
Seznámit prakticky studenty s metodami extrakce a elektroforézy histonů
Seznámit prakticky studenty s metodami štěpení chromatinu MNázou
Student bude schopen modifikovat pracovní postup podle zvoleného materiálu
Osnova
  • 1. Izolace buněčných jader z živočišných a rostlinných tkání 2. Štěpení jader mikrokokovou nukleázou 3. Extrakce nukleozomální DNA 3. Analýza nukleozomální DNA pomocí elektroforézy 4. Příprava mononukleozomální DNA z agarózového gelu 5. mapování polohy nukleozómu pomocí restrikčních enzymů nebo extenze primerů 6. Počítačové modelování polohy nukleozómů 7. Porovnání experimentálních a teoretických výsledků. 8. Extrakce chromatinových proteinů 9. Analýza chromatinových proteinů pomocí SDS-PAGE
Literatura
  • FAJKUS, Jiří, Andrew R. LEITCH, Michael CHESTER a Eva SÝKOROVÁ. Evolution, Composition and Interrelated Functions of Telomeres and Subtelomeres: Lessons from Plants. In Origin and Evolution of Telomeres. USA: Landes Biosciences, 2008, s. 114-127. ISBN 978-1-58706-309-1. info
  • FAJKUS, Jiří a Edward N. TRIFONOV. Columnar Packing of Telomeric Nucleosomes. Biochemical and Biophysical Research Communications. California: Academic Press, 2001, roč. 280, č. 4, s. 961-963. ISSN 0006-291X. info
Výukové metody
Laboratorní cvičení - intenzivní bloková výuka
Metody hodnocení
Písemné vypracování protokolu zdůrazňujícího problémy, s nimiž při řešení projektu došlo. Závěrečná skupinová diskuse o zkušenostech z kursu.
Informace učitele
Předmět se vyučuje blokově v laboratořích pav. A2-ILBIT, univerzitní kampus Brno-Bohunice
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2012/Bi9042