PřF:C9925 Soft matter - Informace o předmětu
C9925 Introduction to soft matter models of membranes and proteins
Přírodovědecká fakultajaro 2012
- Rozsah
- 2/0. 2 kr. (plus 1 za zk). Ukončení: zk.
- Vyučující
- prof. RNDr. Robert Vácha, PhD. (přednášející)
- Garance
- prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Út 14:00–15:50 C04/211
- Předpoklady
- Základní znalosti matematiky a termodynamiky vysokoškolské úrovně
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Biofyzika (angl.) (program PřF, D-FY4)
- Biofyzika (angl.) (program PřF, N-FY)
- Biofyzika (program PřF, D-FY4)
- Biofyzika (program PřF, N-FY)
- Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Aplikovaná biofyzika)
- Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Molekulární biofyzika)
- Biomolekulární chemie (angl.) (program PřF, D-BCH4)
- Biomolekulární chemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
- Biomolekulární chemie (program PřF, D-BCH4)
- Biomolekulární chemie (program PřF, N-BCH)
- Fyzikální chemie (angl.) (program PřF, D-CH4)
- Fyzikální chemie (angl.) (program PřF, N-CH)
- Fyzikální chemie (program PřF, D-CH4)
- Fyzikální chemie (program PřF, N-CH)
- Chemie makromolekulárních látek (angl.) (program PřF, D-CH)
- Chemie makromolekulárních látek (program PřF, D-CH)
- Makromolekulární chemie (program PřF, N-CH)
- Matematické modelování a numerické metody (program PřF, N-MA)
- Materiálová chemie (angl.) (program PřF, D-CH4)
- Materiálová chemie (angl.) (program PřF, N-CH)
- Materiálová chemie (program PřF, D-CH4)
- Materiálová chemie (program PřF, N-CH)
- Molekulární a buněčná biologie (angl.) (program PřF, D-BI4)
- Molekulární a buněčná biologie (program PřF, D-BI4)
- Obecné otázky fyziky (angl.) (program PřF, D-FY4)
- Obecné otázky fyziky (program PřF, D-FY4)
- Organická chemie (angl.) (program PřF, D-CH4)
- Organická chemie (angl.) (program PřF, N-CH)
- Organická chemie (program PřF, D-CH4)
- Organická chemie (program PřF, N-CH)
- Strukturní chemie (program PřF, N-CH)
- Teoretická fyzika a astrofyzika (angl.) (program PřF, D-FY4)
- Teoretická fyzika a astrofyzika (program PřF, D-FY4)
- Teoretická fyzika a astrofyzika (program PřF, N-FY, směr Teoretická fyzika)
- Cíle předmětu
- The course is focused on basic knowledge of proteins and membranes from a soft matter perspective. It covers an overview of coarse-grained models, their approximations and limits in computer simulations. At the end, the lectures will describe a few of the advanced methods of Monte Carlo simulations that are often used in this field.
- Osnova
- 1) Introduction to coarse grained models
- 2) Ideal chain approximation
- 3) Ideal thin membrane
- 4) Interaction of uncharged membrane and proteins
- 5) Interaction of charged membrane and proteins I
- 6) Interaction of charged membrane and proteins II
- 7) Thermodynamic principles of self assembly
- 8) Langmuir adsorption and grand canonical ensemble
- 9) Dynamics and transport
- 10) Advanced Monte Carlo
- Literatura
- Intermolecular and Surface Forces 3rd edition by Jacob N. Israelachvili; Academic Press 2010
- Giant Molecules: Here, There, and Everywhere 2nd edition by Alexander Y. Grosberg et al.; World Scientific Press 2010
- Soft Condensed Matter Physics in Molecular and Cell Biology by W.C.K. Poon and D. Andelman; Taylor & Francis 2006
- Výukové metody
- přednášky
- Metody hodnocení
- písemný testy
- Vyučovací jazyk
- Angličtina
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
- Statistika zápisu (jaro 2012, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2012/C9925