Bi9310c Úvod do kvantitativní RT-PCR – cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2015
Rozsah
0/2. v týdenním bloku. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
( Bi4035 Molekulární biologie - lab.cv. || Bi4020c Základy metod mol. biologie ) && NOW( Bi9310 Kvantitativní RT-PCR )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Návrh a provedení úplného real-time PCR experimentu, včetně správné manipulace s instrumentací a analýzy získaných dat
Osnova
  • Absolutní (AQ) a relativní (RQ) kvantifikace
  • Příprava materiálu; izolace celkové a poly(A)RNA; reverzní transkripce a její varianty; RT-PCR - 5'nukleázová assay, SYBR green
  • Analýza primárních dat, výstupy, statistické zpracování
  • Porozumění standardům MIQE (Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments)
Literatura
  • Real-time PCR. Edited by M. Tevfik Dorak. New York: Taylor & Francis, 2006, xxvi, 333. ISBN 041537734X. info
  • A-Z of quantitative PCR. Edited by Stephen A. Bustin. La Jolla, Calif.: International University Line, 2004, xxix, 882. ISBN 0963681788. info
Výukové metody
cvičení
Metody hodnocení
aktivní účast, protokol
Informace učitele
Cvičení je doporučeno zejména pro studenty, kteří dosud s qRT-PCR nemají přímé praktické zkušenosti. The subject is recommended for students who have no practical experience with qRT-PCR.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, jaro 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024.