C9095 RNA metabolism

Přírodovědecká fakulta
jaro 2015
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 11:00–12:50 C04/211
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Přednáška se koná, pokud počet zapsaných studentů je vyšší než 5.
Mateřské obory/plány
předmět má 19 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Upon successful completion of the course, students will be able: to identify and describe the major classes of RNAs in Eukaryotic cells, to compare their primary, secondary and tertiary structures, to demonstrate the differences in the transcription, processing and function between different types of coding and noncoding RNAs. The students will be able to design an experimental approach how to study the function of given RNA. Moreover, the students will be able to assess the importance of RNA biology studies in mammalian development and disease.
Osnova
  • 1. Introduction to the RNA world 2. Gene expression: prokaryotes versus eukaryotes 3. Transcription of mRNAs 4. Messenger RNA processing: 5' end capping, polyadenylation 5. pre-mRNA splicing 6. RNA editing and trans-splicing 7. Ribosomal RNAs: transcription, processing, localization, ribosome synthesis 8. Noncoding RNAs I: snRNAs, snoRNAs, tRNAs 9. Noncoding RNAs II: CUTs, XUTs, SUTs, PROMPTs etc. 10. RNA silencing 11. RNA surveillance and degradation in the nucleus 12. Translation of mRNA 13. Methods to study gene expression: microarray analysis, RT-PCR, Northern blot, 3' extension, EMSA, RIP-Seq, ChIP-Seq etc.
Literatura
    doporučená literatura
  • RNA Biology. Gunter Meister, Wiley-VCH, Weinheim 2011, XVI+363 pp., ISBN 978-3-527-32278-7
Výukové metody
This class is in the form of lectures and class discussions.
Metody hodnocení
Ten written tests during the lecture courses followed by oral examination. Each test consists of two questions from the preceding lecture. Students can use their notes to answer the questions. 100% of correct answers is needed to pass with the grade A without following oral examination. If less than 100% answers correct, students are given a chance to correct the answers during final oral examination. 50% correct answers are required to pass the exam.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, podzim 2023.