FA600 Vibrační spektroskopie biomolekul

Přírodovědecká fakulta
jaro 2019
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Dušan Hemzal, Ph.D. (přednášející)
Garance
Mgr. Dušan Hemzal, Ph.D.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Dušan Hemzal, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 18. 2. až Pá 17. 5. Po 12:00–12:50 Kontaktujte učitele
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem předmětu je poskytnout informace nezbytné k využití metod vibrační spektroskopie ve výzkumu biologicky významných látek. Posluchači budou seznámeni s teorí molekulových vibrací, nutným přístrojovým vybavením, s podmínkami přípravy vzorků, záznamu spekter a jejich vyhodnocením. Hlavni pozornost při studiu struktury a funkce biomolekul bude zaměřena na využití Ramanovy a infračervené spektroskopie.
Výstupy z učení
Po ukončení předmětu by studenti měli být schopni
- zvolit správný typ vibrační spektroskopie pro charakterizaci konkrétních biologických vzorků
- analyzovat získaná spektra
Osnova
  • Vibrační spektroskopie: infračervená (IČ) a Ramanova spektroskopie (RS).
  • Molekulové vibrace a jejich analýza.
  • Techniky Ramanské spektroskopie: resonanční Ramanova spektroskopie (RRS), povrchem zcitlivěná Ramanova spektroskopie (SERS), hrotem zesílený Ramanův rozptyl (TERS), vibrační cirkulární diochroismus (VCD), Ramanova optická aktivita (ROA), kapková Ramanská spektroskopie (DCDR)
  • Pomocné techniky: refraktometrie, porušený totální odraz v IČ (ATR), elipsometrie (TIRE), mikroskopie skenovací sondy (AFM, STM), tvorba filmů podle Langmuira-Blodgetové (LB)
  • Aplikace: cukry, oligopeptidy, proteiny, nukleové kyseliny, lipidy.
  • Kinetické studie.
  • Instrumentace vibračních spektroskopií.
Výukové metody
přednáška, laboratorní měření
Metody hodnocení
Kolokvium bude probíhat formou diskuse výsledků studentem zvoleného laboratorního projektu zaměřeného na aplikaci vibrační spektroskopie.
Informace učitele
Literatura:

Experimentální metody biofyziky, V. Prosser a kol., 337-365, Academia Praha, 1989.
Infrared and Raman Spectroscopy, Methods and application, B. Schrader, Ed., Wiley-VCH, Weinheim, 1995.
Vibrational Spectroscopy in Life Sciences, F. Siebert and P. Hildebrant, Wiley-VCH, Weinheim, 2008.
Physical Biochemistry, Principles and Application, D, Sheehan, 53-90, Wiley-Blackwell, 2009.
The Physical and Chemical Basis of Molecular Biology, T.E. Creighton, 311-338, Helvetian Press, 2010
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2020, jaro 2021.