Bi7330c Cytologie a morfologie bakterií - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Iva Buriánková, Ph.D. (cvičící)
Garance
Mgr. Iva Buriánková, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 17. 5. 13:00–17:00 E25/111, Po 24. 5. 13:00–17:00 E25/111, Út 25. 5. 8:00–12:00 E25/111
Předpoklady
ROCNIK(1)
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 16 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/16, pouze zareg.: 0/16
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Student bude schopen zvolit vhodnou techniku pro pozorování morfologické diverzity bakteriálních buněk (včetně morfologických vlastností závisejících na kultivačním mediu)a základních struktur bakteriální buňky (endospory, inkluze, bičíky). Bude schopen posoudit využitelnost metodik jak pro klinickou praxi, tak pro environmentální či biotechnologické studie. Student zvládne základní techniky přípravy mikroskopických preparátů pro světelnou mikroskopii (barvené, nativní preparáty, sklíčkové kultury), bude schopen ovládat mikroskopickou techniku (fázový a Nomarského kontrast, pozorování v jasném poli), a pořídit obrazový záznamu z mikroskopu (kamera) i makroskopický snímek (fotoaparát). Seznámí se s digitalizaci obrazu a jeho následným zpracováním a analýzou (NIS - elements).
Výstupy z učení
Výstupem předmětu jsou protokoly obsahující popsané obrázky mikroskopických preparátů (gramovo barvení, strukturální barvení, sklíčkové kultury, fluorescence) získané z badatelského mikroskopu prostřednictvím programu na úpravu obrazu.
Osnova
  • Základní morfologická charakteristika a barvitelnost bakteriálních buněk a buněk archeí.
  • Hodnocení morfologie bakteriálních kolonií.
  • Práce se světelným mikroskopem, seřizování, údržba, odstranění drobných vad.
  • Pořizování, archivace, editace a analýza obrazu v mikrobiologii.
  • Mikrofotografie, práce s digitálním fotoaparátem, využití analogové kamery k pořizování makro- i mikrosnímků v mikrobiologické laboratoři.
  • Měření velikosti bakteriálních buněk a jejich morfologických struktur (využití okulárového mikrometru a software pro analýzu obrazu).
  • Tvary a shluky bakteriálních buněk (morfologická diverzita bakterií).
  • Gramovo barvení. Acidorezistence bakterií, Ziehl-Neelsenovo barvení, mykobakteria. Giemsovo barvení.
  • Spory a sporulace u bakterií.
  • Fázový a Nomarského kontrast.
  • Pouzdra, pochvy a slizy bakteriálních buněk.
  • Pohyb bakteriálních buněk.
  • Příprava sklíčkových kultur.
  • Aktinomycety a metody pozorování jejich morfologie.
  • Měření a srovnání rozměrů jednotlivých skupin mikroorganismů.
  • Barvení buněčné stěny, jaderného materiálu a zásobních látek v buňkách bakterií.
  • Zpracování obrazové dokumentace - digitální protokol.
  • V rámci prvních 11 týdnů semestru budou výše uvedená témata probrána distančně - z této teoretické přípravy bude studenty zpracován ke každému úkolu protokol. V druhé části semestru budou ve 4 týdnech vybrané stěžejní úkoly prováděny prakticky. Následně se bude psát zápočtový test z poznatků získaných z obou částí semestru.
Literatura
  • KOPECKÁ, Jana a Gabriela ROTKOVÁ. Skripta ke cvičení z obecné mikrobiologie, cytologie a morfologie bakterií. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2017. Elportál. ISBN 978-80-210-8788-0. url epub info
Výukové metody
laboratorní cvičení, diskuze výsledků, protokol
Metody hodnocení
V průběhu praktických cvičení se provádí fotografická dokumentace pozorovaných objektů - výsledkem je elektronický protokol. Posuzování vlastních výsledků v průběhu celého semestru. Závěrečné hodnocení sestává z písemného testu, zápočtového preparátu
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2020, jaro 2022, jaro 2025.