E6080 Environmentální genomika

Přírodovědecká fakulta
jaro 2022
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
doc. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D., MBA (přednášející)
doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Albert Kšiňan, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D., MBA
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D., MBA
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit studenty s vědním oborem environmentální genomika, který se zabývá interakcemi mezi člověkem a prostředím na genomové úrovni, tzv. gen-environment interakce, a s tím souvisejícími interakcemi mezi člověkem a jeho mikrobiotou, epigenomikou, genovou expresí, geneticky podmíněnou náchylností ke komplexním chorobám a PGx (farmakogenetika a farmakogenomika).
Výstupy z učení
Student po absolvování předmětu: - bude rozumět tomu, čím se zabývají obory environmentální genomika, PGx a populační genetika, - bude schopný diskutovat o vlivu expozičních faktorů na lidský genom a mikrobiom, - bude umět vysvětlit, co je to genetická predispozice k onemocnění a jaké jsou metody studia genetické složky u komplexních chorob, - bude seznámen s multiomickými přístupy studia lidského zdraví a nemoci.
Osnova
  • 1. Úvod do environmentální genomiky člověka (definice oblastí zájmu: gen-environment interakce, interakce gen-gen, genetika komplexních chorob, epigenomika). 2. Populační genetika, genetické asociační studie, metody studia komplexních chorob. 3. Genetická predispozice (náchylnost) ke komplexním chorobám – studie kontrol a případů. 4. Genetická predispozice (náchylnost) ke komplexním chorobám – imunogenetika a onkogenetika. 5. PGx (farmakogenetika a farmakogenomika) - personalizovaná medicína. 6. Lidský mikrobiom ve zdraví a v nemoci, multiomické přístupy, metatranskriptom, metabolom a metaproteom, vývoj mikrobiomu. 7. Lidský mikrobiom a metabolizace xenobiotik, antibiotická rezistence. 8. Lidský mikrobiom - osa střevo-mozek a neurovývoj a neurodegenerace. 9. Lidský mikrobiom – orální mikrobiom, mikrobiom gastrointestinálního traktu, onkobiom. 10. Lidský mikrobiom a reprodukce. 11. Lidský mikrobiom a epigenetické modifikace. 12. Epigenetika v onkologii.
Literatura
  • https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/290458/sgenomics-e-e.pdf
  • https://doi.org/10.1093/hmg/ddh228
Výukové metody
Výuka je realizována formou přednášky s prezentací.
Metody hodnocení
Návštěva přednášek není povinná, ale silně doporučená pro porozumění probíraným tématům. Závěrečné hodnocení (na konci semestru) bude realizováno formou písemné zkoušky (20 otázek, forma testu) s následnou ústní zkouškou.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2025.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2022/E6080