Bi8670c Principy rostlinných biotechnologií - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2023
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučující
doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Hana Cempírková, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 13:00–14:50 C13/112
Předpoklady
NOW( Bi8670 Rostlinné biotechnologie ) && SOUHLAS
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět navazuje na kurz Bi6120 Rostlinné explantáty, ve kterém se studenti seznámili s jednotlivými metodami kultivace in vitro. Rozšiřuje poznání směrem k využití těchto metod v základním výzkumu rostlin a biotechnologickým aplikacím. Předmět bude zaměřen na základní metody molekulární biologie používané pro přípravu geneticky modifikovaných organizmů (GMO), včetně transgenních rostlin, a cílené modifikace rostlinného genomu (např. CRISPR/Cas9).
Výstupy z učení
Po absolvování tohoto předmětu student získá teoretické i praktické znalosti a bude schopen: • porozumět a popsat hlavní metody používané v molekulární biologii pro přípravu GMO • ovládat přípravu transgenních rostlin a jejich analýzu včetně fluorescenční a konfokální mikroskopie • pochopit a analyzovat přínosy a rizika moderních rostlinných biotechnologií.
Osnova
  • • Základní postup přípravy geneticky modifikovaných rostlin • Genomické databáze, design primerů, PCR • Izolace plasmidové DNA, její stěpení a elektroforéza • Základy klonování • Techniky pro transformaci E. coli a agrobakteria • Transformace tabáku metodou in vitro • Transformace Arabidopsis thaliana metodou floral dip • Chemicky indukovatelné systémy, GUS barvení • Selekce transformantů • Fluorescenční proteiny a fluorescenční mikroskopie • Metoda cílené modifikace genomu (CRISPR/Cas9) • Transientní exprese v tabáku a konfokální mikroskopie • Přínosy a rizika GMO, legislativa.
Literatura
  • Agrobacterium-mediated transformation of Arabidopsis thaliana using the floral dip method. Zhang, X., Henriques, R., Lin, S.-S., Niu, Q.-W. and Chua, N.-H. NATURE PROTOCOLS 2006, 1:1-6.
  • Editing plant genomes with CRISPR/Cas9. Belhaj, K., Chaparro-Garcia, A., Kamoun, S., Patron, N.J. and Nekrasov, V. Current Opinion in Biotechnology 2015, 32:76–84.
  • ŠÁMALOVÁ, Markéta, C. KIRCHHELLE a I. MOORE. Universal Methods for Transgene Induction Using the Dexamethasone-Inducible Transcription Activation System pOp6/LhGR in Arabidopsis and Other Plant Species. 2019. ISSN 2379-8068. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cppb.20089. URL info
  • Applied plant cell biology : cellular tools and approaches for plant biotechnology. Edited by Peter Nick - Zdeněk Opatrný. Berlin: Springer, 2014, xiv, 481. ISBN 9783642417863. info
  • ALBERTS, Bruce, Alexander JOHNSON, Julian LEWIS, David Owen MORGAN, Martin C. RAFF, Keith ROBERTS a Peter WALTER. Molecular biology of the cell. Edited by John H. Wilson - Tim Hunt. Sixth edition. New York, NY: Garland Science, 2014, xxxiv, 134. ISBN 9780815344322. info
  • Medicinal plant biotechnology. Edited by Rajesh Arora. Cambridge, Mass.: CABI, 2010, xv, 357 p. ISBN 9781845936921. info
  • SAMBROOK, Joseph a David W. RUSSELL. Molecular cloning : a laboratory manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001, 1 sv. ISBN 0879695765. info
Výukové metody
praktická výuka
Metody hodnocení
Test.
Další komentáře
Předmět je vypisován v jarních semestrech sudých let.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2016, jaro 2018, jaro 2019.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2023/Bi8670c