PřF:C8800 Rtg strukturní analýza - Informace o předmětu

C8800 Rtg strukturní analýza

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–11:50 Kontaktujte učitele

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Analytická chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Analytická chemie (program PřF, M-CH)
• Anorganická chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Anorganická chemie (program PřF, M-CH)
• Anorganická chemie (program PřF, N-CH)
• Biochemie (program PřF, M-CH)
• Fyzikální chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Fyzikální chemie (program PřF, M-CH)
• Chemie makromolekulárních látek (program PřF, D-CH) (2)
• Chemie odborná (program PřF, M-CH)
• Chemie životního prostředí (program PřF, D-CH) (2)
• Chemie životního prostředí (program PřF, M-CH)
• Makromolekulární chemie (program PřF, M-CH)
• Organická chemie (program PřF, D-CH) (2)
• Organická chemie (program PřF, M-CH)

Cíle předmětu

Cílem výuky je vysvětlit studentům základní principy monokrystalové rtg. strukturní analýzy, uvést je do kinematické teorie monokrystalové difrakce a seznámit je s přístroj. výbavou používanou při difrakčním experimentu a metodami pro vyhodnocování experimentálních RTG dat. Na rozdíl od analogického kursu CB070 Proteinová krystalografie je základní pozornost kursu C8800 soustředěna na krystalografii tzv. malých molekul.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu student bude znát: - principy monokrystalové rtg. strukturní analýzy; - historii rtg. krystalografie; - přístrojovou instrumentaci rtg. krystalografie; - základní postupy rtg. krystalografie; - uživatelská znalost krystalografických programů ShelxS a ShelxL a SW pro práci krystalografickými datatabázemi

Osnova

• Symetrie látek
• Interakce rtg. záření s látkou
• Difrakce na krystalu
• Zdroje a detektory rtg. záření
• Difraktometry
• Fázový problém
• Pattersonovské a přímé metody
• Upřesňování modelu, R-faktory, metoda nejmenších čtverců.
• Programy SHELXS a SHELXL
• Příprava proteinových krystalů
• Proteiny a metody kovových derivátů
• Upřesňování proteinových strukturních modelů
• Krystalografické databáze

Literatura

• MAREK, Jaromír a Z. TRÁVNÍČEK. Monokrystalová rentgenová strukturní analýza. první. Olomouc: Vydavatelství Univerzity Palackého, 2002, 169 s. nedělí se na edice. ISBN 80-244-0551-2. info
• GIACOVAZZO, C. Fundamentals of Crystallography. 1992. ISBN 0-19-855578-4. info

Výukové metody

Teoretická příprava. Domácí práce prováděná na počítači.

Metody hodnocení

Během semestru je vyžadována domácí práce na počítači. Ústní zkouška či kolokvium

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (jaro 2023, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2023/C8800