E4013 Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika

Přírodovědecká fakulta
jaro 2023
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučující
doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. David Bednář, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (přednášející)
doc. Ing. Vlad Popovici, PhD (přednášející)
Mgr. Jan Böhm (cvičící)
Mgr. Soňa Smetanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Barbora Zwinsová (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Pá 10:00–11:50 D29/347-RCX2
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
V průběhu předmětu studenti týmově řeší zadanou úlohu z oblasti bioinformatiky. Hlavním cílem předmětu je podpořit schopnost studentů pracovat týmově a spolupracovat na zadané úloze a realizaci jednotlivých kroků analýzy včetně prezentace výsledků.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen: - praktického nastudování biologické a bioinformatické podstaty problému a metod, - praktického provedení bioinformatického úkolu - týmové spolupráce - prezentace výsledků
Osnova
  • Zadání studentských prací bude vybráno z následujících oblastí: - analýza dat sekvenování nové generace (genomika, transkriptomika, metagenomika - mikrobiom) - analýza sekvencí DNA - analýza dat hmotnostních spektrometrie (metabolomika, proteomika) - strukturní bioinformatika - a pod
Literatura
  • KOLAJOVÁ, Lenka. Týmová spolupráce : jak efektivně vést tým pro dosažení nejlepších výsledků. 1. vyd. Praha: Grada, 2006, 105 s. ISBN 8024717646. URL info
Výukové metody
Diskuse nad zadanými úkoly, průběžné prezentace řešení.
Metody hodnocení
Kritické zhodnocení řešení zadaného úkolu.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2024, podzim 2024.