Bi4030cen Laboratory Course in Molecular Biology

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
0/3/0. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (cvičící)
Garance
Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 19. 2. až Ne 26. 5. Čt 13:00–16:50 D36/216
Předpoklady
(! Bi4030c Molekulární biologie - cv. ) && !NOWANY( Bi4030c Molekulární biologie - cv. )
Basic knowledge of general genetics, microbiology, inorganic chemistry, organic chemistry and biochemistry.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
This practical course is conceived as an introduction to methods of molecular biology. At the end of the course, students should be able to analyze genetic material including chromosomal DNA and perform cloning experiments with bacterial plasmids.
Výstupy z učení
Student will be able to:
isolate plasmid DNA of sufficient quality and quantity;
analyze isolated genetic material by basic methods of molecular biology such as restriction endonuclease cleavage and ELFO;
prepare sufficient amount of PCR amplicon of the gene of interest;
use the isolated plasmid and the prepared PCR product to create a recombinant vector;
transfer the construct to E. coli cells and select transformants;
use gained knowledge in subsequent laboratory practice.
Osnova
  • 1. Preparation of solutions and stock enzymes used in molecular biology.
  • 2. Isolation of plasmid DNA (pUC series, pBluescript). Determination of DNA concentration and purity.
  • 3. Polymerase chain reaction (PCR)
  • 4. Restriction analysis of nucleic acids, agarose gel electrophoresis.
  • 5. Restriction mapping, isolation of DNA from agarose gels.
  • 6. DNA cloning in basic types of vectors, DNA transfer to prokaryotic cells, transformation, selection of clones.
  • 7. Centrifugation techniques, preparation of saccharose density gradients.
Literatura
    povinná literatura
  • Protocols in Study Materials in IS and PowerPoint presentations
    doporučená literatura
  • S. Carson, H. B. Miller, M. C. Srougi, D. S. Witherow. Molecular Biology Techniques (4th Ed.) - A Classroom Laboratory Manual. Academic Press, 2019. eBook ISBN: 9780128157756, Paperback ISBN: 9780128180242
Výukové metody
The practical course is taught in seven 5-hour blocks in a molecular biology laboratory. Students perform the methods according to pre-examined protocols.
Metody hodnocení
The prerequisite for successful completion of the course is participation in all practical exercises, elaboration of protocols from performed experiments and passing a written exam focused on practical questions.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2022, jaro 2023, jaro 2025.