C9531 Strukturní biochemie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2002
Rozsah
0/1/0. 1 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Fadrná, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Předpoklady
NOW( c9530 Strukturní biochemie )
Cvičení je určeno studentům navštěvujícím přednášku C9530 (strukturní biochemie).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem cvičení je poskytnout možnost prakticky procvičit znalosti získané v přednášce C9530 (strukturní biochemie) a připravit studenty na zkoušku kurzu C9530.
Osnova
  • 1. Pojem struktury makromolekul, základní strukturní motivy proteinů, nukleových kyselin, struktura sacharidů a membrán. 2. Základní charakterizace proteinů, metody optické a hmotnostní spektroskopie, sekvenace proteinů. 3. Sekvenace nukleových kyselin, metody genového inženýrství, exprese rekombinantních proteinů. 4-6. Rentgenová struktrurní analýza. Příprava krystalů, difrakční experiment, metody řešení fázového problému, mapy elektronové hustoty, výstavba strukturního modelu. 7-9. Nukleární magnetická rezonance. Izotopové značení, NMR experiment, přiřazení frekvencí ve spektrech, určení geometrie (NOE, interakční konstanty), dynamika proteinů. 10-11. Molekulová mechanika a dynamika, simulované žíhání, zahrnutí experimentálních dat. 12. Databáze struktur, bioinformatika, počítačové předpovídání a modelování.
Informace učitele
http://www.chemi.muni.cz/~lzidek/C9530.html
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.