C9531 Strukturní biochemie - seminář

Přírodovědecká fakulta
podzim 2010
Rozsah
0/1/0. 1 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Jiří Nováček, Ph.D. (cvičící), prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (zástupce)
Garance
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Rozvrh
Čt 11:00–11:50 B09/316, Čt 12:00–12:50 B09/316, Čt 13:00–13:50 B09/316
  • Rozvrh seminárních/paralelních skupin:
C9531/11_hod: Rozvrh nebyl do ISu vložen.
C9531/12_hod: Rozvrh nebyl do ISu vložen.
C9531/13_hod: Rozvrh nebyl do ISu vložen.
Předpoklady
NOW( c9530 Strukturní biochemie )
Cvičení je určeno studentům navštěvujícím přednášku C9530 (strukturní biochemie).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem cvičení je poskytnout možnost prakticky procvičit znalosti získané v přednášce C9530 (strukturní biochemie) a připravit studenty na zkoušku kurzu C9530. Studenti navštěvující kurz budou schopni analyzovat molekulové struktury, řešit úkoly zadávané jako reálné příklady z laboratorní praxe a kombinovat výsledky různých druhů analýz pro získání komplexního řešení.
Osnova
  • 1. Určení torzních úhlů, práce s modelem proteinů. 2. Práce s modelem nukleových kyselin, určení pseudorotace. 3. Program Rasmol, ukázka molekulové mechaniky. 4. Sekvenace nukleových kyselin, navrhování místně řízené mutageneze. 5. Sekvenace peptidů hmotnostní spektrometrií. 6. Interpretace IR a CD spekter proteinů. 7. Přiřazení NMR spekter sekvenci proteinů. 8. Přiřazení NMR spekter sekvenci nukleových kyselin. 9. Rtg. difrakce - rozlišení, fázový problém a upřesňování. 10. Práce s databázemi sekvencí a struktur.
Literatura
  • LESK, Arthur M. Introduction to protein architecture : the structural biology of proteins. Oxford: Oxford University Press, 2001, xii, 347. ISBN 0198504748. info
  • CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
Výukové metody
V průběhu semestru jsou zadávány praktické úkoly. Po detailní analýze vzorového řešení prokazují studenti schopnost samostatného řešení úkolů formou testů.
Metody hodnocení
K zápočtu je požadovaná úspěšnost alespoň 60 % v každém testu (neúspěšné testy je nutno opakovat). V případě neúčasti je nutno vyřešit test v náhradním termínu. Obsahem testů budou úlohy zadávané během zkoušky z předmětu C9530, úspěšné řešení testů bude u zkoušky z předmětu C9530 zohledněno.
Informace učitele
http://www.ncbr.chemi.muni.cz/~lzidek/C9531/C9531.html
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.