Bi5042 Biostatistický seminář II

Přírodovědecká fakulta
podzim 2004
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: kz.
Vyučující
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Jan Mužík, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Adam Svobodník, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Doporučeno absolvování předmětu Bi5040 Biostatistika - základní kurz.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
Prakticky orientovaný kurz aplikované analýzy dat navazující na Biostatistický seminář I a nabízený studentům, kteří navštíví během 1-3 let studia více tematických okruhů. Seminář je součástí řady praktických kurzů Biostatistický seminář I-III a pro plné absolvování je celkově třeba navštívit 18 intenzivních lekcí (rožně obměňovaná témata). Charakteristika výuky odpovídá biostatistickému semináři I, liší se tematickým zaměřením: Seminář je zaměřován na posluchače s různou úrovní základních znalostí a nemá žádné požadavky na dříve dosažené vzdělání nebo absolvované kurzy. Pro řádné studenty oboru biologie je však vhodné jej zapisovat v návaznosti na základní kurz Biostatistika (Bi5040). Výuka je prakticky orientovaná a probíhá přímo výcvikem na počítačích. Seminář lze zakončit zápočtem na základě absolvování 6 tematických okruhů dle výběru posluchače, posluchači mohou i navrhovat vlastní témata. Pro školní rok 2002/2003 jsou jako nosná témata vypsána témata (1) Biodiverzita a ekologická diverzita a (2) Statistický minor v prediktivní medicíně. Tato témata jsou nabídnuta v celkem 13 samostatných kurzech. Předmět je vypisován každý rok s jinými nosnými tématy.
Osnova
  • Tématický okruh č. 1 pro školní rok 2002/2003: Biodiverzita a ekologická diverzita
  • 1. Kurz 1. MS Office v analýze ekologických dat- databáze, algoritmování
  • 2. Kurz 2. Algoritmy pro ekologická data I. Charakteristika společenstev, diverzita
  • 3. Kurz 3. Algoritmy pro ekologická data II. Metriky podobností a vzdáleností
  • 4. Kurz 4. Algoritmy pro ekologická data III. Valence, nika
  • 5. Kurz 5. Algoritmy pro ekologická data IV. "Species-abundance" modely, interpretace
  • 6. Kurz 6. Vícerozměrné metody v ekologii - shluková, ordinační analýza
  • 7. Kurz 7. Užití diferenciálních rovnic v deterministických modelech v biologii a ekologii
  • Tématický okruh č. 2 pro školní rok 2002/2003: Statistický minor v prediktivní medicíně
  • 1. Kurz 1. Prediktivní analýzy u klinických dat - přehled
  • 2. Kurz 2. Analýza přežití I. Základy
  • 3. Kurz 3. Analýza přežití II. Prediktivní modely
  • 4. Kurz 4. Specifita a sensitivita diagnostických testů, ROC křivky
  • 5. Kurz 5. Jak definovat "cut-off" hodnoty parametrů?
  • 6. Kurz 6. Vícerozměrné metody - aplikace u klinických dat
Literatura
  • MELOUN, Milan a Jiří MILITKÝ. Statistické zpracování experimentálních dat. [1. vyd.]. Praha: Plus, 1994, 839 s. ISBN 80-85297-56-6. info
  • Snedecor G.W. and Cochran W.G. (1971). Statistical methods. Iowa State University Press.
  • Zar J.H. (1984). Biostatistical analysis. Perntice Hall. New Jersey.
  • LEGENDRE, Pierre a Louis LEGENDRE. Numerical ecology. 2nd engl. ed. Amsterdam: Elsevier, 1998, xv, 853 s. ISBN 0-444-89249-4. info
  • SOKAL, Robert R. a James F. ROHLF. Biometry :the principles and practice of statistics in biological research. 3rd ed. New York: W.H. Freeman and Company, 1995, xix, 887 s. ISBN 0-7167-2411-1. info
  • Magurran A., 1983: Ecological diversity and its measurement. Croom Helm, London
  • Cajo J.F. ter Braak, (1996). Unimodal models to relace species to environment. DLO-Agricultural Mathematics Group, Wageningen
  • Jongman, Ter Braak and Van Tongeren (1995). Data analysis in community and landscape ekology, Cambridge University Press, Cambridge
  • BLAND, Martin. An introduction to medical statistics. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1996, xiv, 396. ISBN 0192624288. info
  • Altman D. G. (1991) Practical statistics for medical research. Chapman and Hall. London.
  • HAVRÁNEK, Tomáš. Statistika pro biologické a lékařské vědy. 1. vyd. Praha: Academia, 1993, 476 s. ISBN 8020000801. info
  • HEBÁK, Petr a Jiří HUSTOPECKÝ. Vícerozměrné statistické metody s aplikacemi. Praha: SNTL - Nakladatelství technické literatury, 1987. info
  • Flury B. and Riedwyl H. (1988) Multivariate statistics. A practical approach. Chapman and Hall, London.
Informace učitele
http://www.cba.muni.cz/vyuka/
Další komentáře
Předmět je vyučován každý semestr.
Výuka probíhá každý týden.
Poznámka k četnosti výuky: možnost blokové výuky.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2002, jaro 2003, podzim 2003, jaro 2004, jaro 2005.