Bi5180 Genetika kvantitativních znaků

Přírodovědecká fakulta
podzim 2007 - akreditace
Rozsah
2/2/0. 4 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
RNDr. Ing. Karel Chroust, Ph.D. (přednášející)
Garance
RNDr. Ing. Karel Chroust, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Ing. Karel Chroust, Ph.D.
Předpoklady
( Ex_3162 Obecná genetika || Imp_9126 Obecná genetika || B1900 Obecná genetika || BMB32 Obecná genetika || B6730 Genetika || B8470 Genetika || B3060 Obecná genetika || Bi3060 Obecná genetika ) && ( Bi5040 Biostatistika - základní kurz || NOW( Bi5040 Biostatistika - základní kurz ))
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednášky obsahují přehled historických a prehistorických záznamů z oblasti šlechtění zvířat a rostlin. Popis kvantitativní proměnlivosti, plynulé variability, populačního průměru, užitkovosti a matematických přístupů k výpočtu základních parametrů. Další výklad je zaměřen na složky fenotypové variance a jejich odchylky, genetickou a environmentální kovarianci a opakovatelnost. Příbuznost a inbríding, výpočet koeficientu příbuznosti a inbredního koeficientu, dráhové diagramy a rodokmeny, inbrední depresi a heterozi. Heritabilita a její odhady z variance, korelace a regrese, pomocí jednoduchých a vícerozměrných třídění. Selekce mezi a uvnitř populací, reakce na selekci, selekční index. Segregační analýza. Metody mapování polygenů a jejich přenosu. Praktické aplikace genetiky kvantitativních znaků u rostlin (rýže, kukuřice, pšenice, řepka, topol a smrk) a živočichů (prasata, skot, myši, krysy, drozofila). Součástí kurzu je exkurse ve šlechtitelské stanici prasat a drůbeže v Žabčicích a semestrální selekční experiment u Drosophila melanogaster.
Osnova
  • Historie genetiky kvantitativních znaků. Plynulá variabilita, populační průměr a průměrný účinek genu, kvantitativní proměnlivost, užitkovost, Pascalův trojúhelník, odhad počtu genů v polygenním systému. Složky fenotypové variance a jejich odchylky, genetická a environmentální kovariance, opakovatelnost, predikce užitkovosti. Regrese potomků na rodiče. Příbuznost a inbreeding, koeficient příbuznosti, inbrední koeficient, dráhové diagramy a rodokmeny, inbrední deprese, heteroze. Heritabilita, odhad heritability z variance, korelace u dvojčat, jednoduché a dvojné třídění, hierarchické třídění, faktorové třídění, přesnost odhadů heritability. Selekce mezi populacemi, uvnitř populací, reakce na selekci, selekční index. Segregační analýza. Metody přenosu a mapování genů kvantitativních znaků. Kvantitativní znaky u člověka, dědičné defekty polygenní povahy. Praktické aplikace genetiky kvantitativních znaků u živočichů (prasata, skot a ovce), rostlin (rýže, kukuřice, řepka, topol, smrk) a u laboratorních zvířat.
Literatura
  • Falconer, D. S. - Mackay, Trudy F. C. Introduction to quantitative genetics [Falconer, 1997]. 4th ed. Essex : Longman, 1997. xv, 464 s. r99. ISBN 0-582-24302-5.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.