PřF:C8857 Study of interactions between

C8857 Study of interactions between proteins and DNA

Přírodovědecká fakulta
podzim 2007

Rozsah

1/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

Biochemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
Biochemie (angl.) (program PřF, N-BCH3)
Biochemie (program PřF, N-BCH)
Biochemie (program PřF, N-BCH3)
Biochemie (program PřF, N-CH)
Biologie (program PřF, N-BI)
Biomolekulární chemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
Biomolekulární chemie (angl.) (program PřF, N-BCH3)
Biomolekulární chemie (program PřF, N-BCH)
Biomolekulární chemie (program PřF, N-BCH3)
Makromolekulární chemie (program PřF, N-CH)
Makromolekulární chemie (program PřF, N-CH3)
Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI)
Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI, směr Genomika a proteomika)
Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI, směr Molekularni a geneticka diagnostika)

Osnova

1) General concept DNA RNA PROTEIN; Proteins - their structure, assmebly, and folding; Mad cow and other disease; Domains and motifs; Predictions. 2) Why and how do the proteins interact; Little bit of Math; Data mining; Protein localization (NLS), membrane transport , transport in cytosol etc.); Role of protein interactions (cell cycle, enviroment and hormon responses). 3) Modification of protein interactions, their role and types (phosphorylation, Ubq, Sumo, glycosilation, 4) DNA-protein interactions, types of interaction motivs, their roles (replication, transcription, repair), modification again 5) Methods of study (microscopy, Y2H, FRET, in vitro /pulldow). 6) Methods II (IP,CHIP, far western, EMSA, Biocore etc.). 7) Single protein versus complex of proteins. 8) Examples: DNA repair mechanisms, from single protein to multi-protein complexes. 9) DNA repair II

Vyučovací jazyk

Angličtina

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.