Bi6888 Modelování a konstrukce proteinů

Přírodovědecká fakulta
podzim 2010 - akreditace
Rozsah
0/2. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)
doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Předpoklady
schopnost komunikovat v angličtině
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 25 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/25, pouze zareg.: 0/25, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/25
Jiné omezení: registration to this course must be approved by teachers
Mateřské obory/plány
předmět má 26 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
V rámci odborného semináře "Modelování a konstrukce proteinů" se studenti seznámí s různými aspekty výzkumu a vývoje zaměřeného na konstrukci proteinů metodami racionálního designu a řízené evoluce. Na semináři jsou diskutovány teoretické a experimentální problémy proteinového inženýrství včetně transferu výsledků výzkumu do praxe. Mikrobiálni enzymy halogenalkandehalogenasy slouží jako modelový systém pro demonstraci různých strategií používaných v proteinovém inženýrství. Studenti týdně referují o průběhu řešení samostatného výzkumného projektu. Učí se přednášet odbornou tématiku vlastní vědecké práce i výsledky publikované v odborných časopisech formou "Journal Clubs". Studenti jsou systematicky vedeni ke kritickému hodnocení obsahové a formální stránky prezentací. Na semináři jsou rovněž informováni o nejnovějších poznatcích v oboru prezentovaných na odborných konferencích a sami referují o zkušenostech ze setkání, kterých se v průběhu roku zúčastnili. V rámci semináře studenti získávají první zkušenosti s vedením odborných seminářů a přípravou zápisů z jednání.
Osnova
  • Screening of New Proteins by Bioinformatic Analysis
  • Rational Design of Proteins by Computer Modelling
  • Construction of Modified Proteins by Site-Directed Mutagenesis and Directed Evolution
  • Characterization of Modified Proteins by Biochemical and Biophysical Techniques
Literatura
  • Protein Structure and Function, Gregory A. Petsko, Dagmar Ringe, New Science Press, 2004 ISBN 1405119225, 9781405119221, str. 195
Metody hodnocení
zápočet
Informace učitele
The course is primarily meant for the students working on enzymes haloalkane dehalogenases. These enzymes serve as the model system for the application of protein design and engineering of strategies. The course can also be completed outside the examination period. The course is taught annually. Information on course enrollment limitations: registration to this course must be approved by teachers.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, podzim 2008, jaro 2009, podzim 2009, jaro 2010, podzim 2010, jaro 2011, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, podzim 2014.