CG030 Structure and function of protein complexes

Faculty of Science
Autumn 2010 - only for the accreditation
Extent and Intensity
2/0. 2 credit(s) (plus 2 credits for an exam). Type of Completion: zk (examination).
Teacher(s)
doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat. (lecturer)
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (lecturer)
Guaranteed by
doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat.
Department of Biochemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Course Enrolment Limitations
The course is offered to students of any study field.
Course objectives (in Czech)
Studenti by měli získat základní informace o proteinech a proteinových komplexech. Měli by se seznámit s příklady nejznámějších molekulárních komplexů a porozumět jejich funkčnímu uspořádání.
Syllabus (in Czech)
  • Základy a principy strukturní proteomiky (JP)
  • Úvod – stavba a vlastnosti, syntéza proteinů, skládání – strukturní úrovně, domény, podjednotky a tvorba komplexů, skládání komplexů do velkých funkčních jednotek
  • Metody studia proteinů (JM)
  • Elektroforetické metody, hmotnostní spektrometrie, metody strukturní analýzy (CD, krystalografie, NMR), modelování struktur
  • Proteinové interakce (JP a JM)
  • Proteinové domény, proteinové povrchy, protein-proteinová vazba, DNA-protein, RNA-protein, ligand-protein, metody studia proteinových interakcí (dvojhybridní systémy, pull-down assay, NMR, crosslinking), protein networks
  • Přechodné proteinové interakce (JP)
  • Přechodné interakce, přenos signálu, transport
  • Modifikace proteinů (JP)
  • Protoproteiny, sestřih proteinů, post-translační modifikace proteinů, glykoproteiny, fosforylace, metylace, acetylace, ubiquitinace, SUMOylace
  • Proteinové komplexy a jejich funkce (JP a JM)
  • Chromatinové komplexy (nukleosom, SMC komplexy, shelterin), membránové struktury, proteinové „stroje“ (ribosom)
  • Metody studia proteinových komplexů (JM)
  • Frakcionace, imunoprecipitace, TAP-tag, crosslinking, hmotnostní spektrometrie
  • Evoluce biomakromolekul (JP)
  • Evoluce a koevoluce proteinů, neofunkcionalizace proteinů a komplexů
Teaching methods (in Czech)
výuka je založena na ppt prezentacích a jejich výkladu.
Assessment methods (in Czech)
zkouška ústní
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2013, Spring 2014, Spring 2015, Spring 2016, Spring 2017, spring 2018, Spring 2019, Spring 2020, Spring 2021, Spring 2022, Spring 2023, Spring 2024, Spring 2025.