Bi4070 Analýza obrazu a mikrofotografie v biologii

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011 - akreditace

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
RNDr. Dušan Kadlec, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Božena Koubková, Ph.D. (pomocník)
Garance
RNDr. Božena Koubková, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Dušan Kadlec, Ph.D.
Předpoklady
Bi2302 Zoologická mikrotechnika
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 60 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/60, pouze zareg.: 0/60, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/60
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit studenty biologických oborů s principy pořizování obrazových dat a využití analýzy obrazu v biologii;
rozšíření a prohloubení znalostí mikroskopické techniky, světelné a fluorescenční mikroskopie;
osvojení zákonitostí manuálního i automatického měření a hodnocení obrazových dat v biologických oborech.
Kurs je orientován aplikačně, nevyžaduje speciální matematické znalosti.
Osnova
  • Současná dokumentační zařízení, digitální fotoaparáty, TV a digitální kamery, digitalizace signálu.
  • Pořizování a archivace obrazových dat, principy manuálního a automatického měření biologických objektů, popis objektů.
  • Předzpracování a prahování obrazu, binární editor. Základy klasifikace objektů.
  • Využití analýzy obrazu v patologii, toxikologii (Comet Assay) a cytogenetice (fluorescenční in situ hybridizace, komparativní genomová hybridizace, karyotypování chromozomů).
Literatura
  • PURVES, Dale a R.BEAU LOTTO. Why we see what we do: An Empirical Theory of Vision. Sinauer Associates, Inc., 2003, 260 s. ISBN 0-87893-752-8. info
Výukové metody
Teoretická příprava s praktickými ukázkami, diskuse
Metody hodnocení
přednášky s doporučenou účastí, diskuze v hodině, dobrovolné návštěvy odborných pracovišť závěrečný test, kolokvium
Další komentáře
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.