Bi6700c Taxonomie prokaryot - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011 - akreditace

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučující
prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc. (cvičící)
Mgr. Andrea Vávrová, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.
Předpoklady
NOW( Bi6700 Taxonomie prokar. )
Zkouška z obecné mikrobioloige, fyziologie bakterií, biochemie, molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Jiné omezení: Limitujici je kapacita cvicebny
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Na konci tohoto kurzu bude student schopen samostatně provést: - izolaci a kultivaci mikroorganizmů, uchovávání čistých kultur; - mikroskopickou a makroskopickou morfologie archaeí i bakterií; - fenotypovou klasifikaci a diagnostiku gramnegativních bakterií; - fenotypovou klasifikaci a diagnostiku grampozitivních bakterií; - typizaci a identifikaci bakterií metodou rep-PCR; - analýzu mikroorganizmů hmotnostní spektrometrií MALDI TOF.
Osnova
  • Pevná a tekutá média
  • Izolace
  • Kultivace
  • Morfologie
  • Klasifikace fermentujících tyček
  • Klasifikace nefermentujících tyček
  • Klasifikace G+ koků a tyček (kmeny Actinobacteria, Firmicutes)
  • rep_PCR
  • MALDI TOF MS
  • Zhodnocení identifikace
Literatura
  • SEDLÁČEK, Ivo. Taxonomie prokaryot. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2007, 270 s. 55-969C-2006 02/58 12Př. ISBN 80-210-4207-9. info
  • Goodfellow M. and O Donnell A.G. : Chemical methoda in procaryotic systematics. J.Wiley and sons, N.Y., 1994
  • Gerhardt, P., Murray, R.G.E., Wood, W.A., Krieg, N.R. (eds.). 1994. Methods for general and molecular bacteriology. ASM, Washington, D.C.
  • Murray, PB., Baron, E.J., Jorgensen, J.H., Pfaller, M.A., Yolken, R.H. (eds.). 2003. Manual of clinical microbioloogy. Volume 1. 8th edition. ASM Press. Washington, D.C.
  • Pershing, D.H., Tenover, F.C., Versalovic, J., Tang, Y.W., Unger, E.R., Relman, D.A., White, TJ. (eds.). 2004. Molecular microbiology: diagnostic principles and practice. ASM Press, Washington, USA.
Výukové metody
Teoretická příprava a na ni navazující laboratorní cvičení.
Metody hodnocení
Dva písemné testy pro připuštění ke cvičením (30 a 50 otázek), praktické cvičení, zápočet.
Navazující předměty
Informace učitele
Cvičení je určeno pouze pro studenty PřF MU zaměření mikrobiologie.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.