PřF:Bi7050c MS proteinů - cvičení - Informace o předmětu

Bi7050c Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií - cvičení

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: z. Jiná možná ukončení: kz.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)

Garance

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.

Předpoklady

NOW( Bi7050 Charakterizace proteinů MS )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Mateřské obory/plány

• Analytická biochemie (program PřF, N-BCH)
• Analytická chemie (program PřF, N-CH)
• Biofyzika (program PřF, D-FY4)
• Biofyzika (program PřF, N-FY)
• Biochemie (program PřF, D-BCH4)
• Biochemie (program PřF, N-BCH)
• Biochemie (program PřF, N-CH)
• Biologie (program PřF, N-BI)
• Biomolekulární chemie (program PřF, D-BCH4)
• Biomolekulární chemie (program PřF, N-BCH)
• Genomika a proteomika (program PřF, D-BI4)
• Mikrobiologie (program PřF, D-BI4)
• Molekulární a buněčná biologie (program PřF, D-BI4)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI)
• Obecná a molekulární genetika (program PřF, D-BI4)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Ekotoxikologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Fyziologie rostlin)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Fyziologie živočichů)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět základům identifikace proteinů pomocí MS a MS/MS dat;
vybrat a používat vhodný prohledávací program pro identifikaci proteinů;
porozumět základům interpretace MS/MS spekter;

Osnova

• Interpretace MS dat;
• Interpretace MALDI-MS/MS a ESI-MS/MS dat;
• Identifikace proteinů pomocí MS a MS/MS dat;
• Úvod do de-novo sekvenování;
• Charakterizace modifikací proteinů - určení druhu a místa;

Literatura

doporučená literatura
• SNYDER, Peter A. Interpreting protein mass spectra :a comprehensive resource. Oxford: Oxford University Press, 2000, xi, 522 s. ISBN 0-8412-3571-6. info

Výukové metody

praktická cvičení na počítači

Metody hodnocení

individuální zpracování modelových dat

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý druhý týden.

• Statistika zápisu (podzim 2011 - akreditace, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2011-akreditace/Bi7050c