Bi7050c Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011
Rozsah
0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: z. Jiná možná ukončení: kz.
Vyučující
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
Rozvrh
Pá 8:00–9:50 C02/211
Předpoklady
NOW( Bi7050 Charakterizace proteinů MS )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
předmět má 26 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět základům identifikace proteinů pomocí MS a MS/MS dat;
vybrat a používat vhodný prohledávací program pro identifikaci proteinů;
porozumět základům interpretace MS/MS spekter;
Osnova
  • Interpretace MS dat;
  • Interpretace MALDI-MS/MS a ESI-MS/MS dat;
  • Identifikace proteinů pomocí MS a MS/MS dat;
  • Úvod do de-novo sekvenování;
  • Charakterizace modifikací proteinů - určení druhu a místa;
Literatura
    doporučená literatura
  • SNYDER, Peter A. Interpreting protein mass spectra :a comprehensive resource. Oxford: Oxford University Press, 2000, xi, 522 s. ISBN 0-8412-3571-6. info
Výukové metody
praktická cvičení na počítači
Metody hodnocení
individuální zpracování modelových dat
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2010, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012.