Bi8490 Využití PC v biologii

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011 - akreditace

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
prof. Ing. Miloš Barták, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Josef Hájek, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. Ing. Miloš Barták, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Ing. Miloš Barták, CSc.
Předpoklady
Základní znalost práce s PC: (a)ovládání Windows, (b)operace se soubory (kopírování, přejmenování, mazání), (c)základní znalost textového editoru (např. MS Word), (d)požadována je alespoň minimální znalost anglického jazyka, (e)požadována je alespoň minimální znalost e-mailové komunikace
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 26 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/26, pouze zareg.: 0/26, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/26
Jiné omezení: (1)V případě vyššího počtu zájemců mají přednost studenti se zaměřením "Fyziologie rostlin". (2) V pripadě vyššiho počtu zájemců rozhoduje dřívější (časnější datum) registrace.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem je naučit posluchače efektivně využívat PC pro svoje studium a vědeckou práci.
Osnova
  • (1) Přehled využití PC v biologii (komunikace, sběr a analýza dat, řízení experimentů, bioinformatika, analýza obrazu, 3D grafika, nanotechnologie, modelování molekul) – současné trendy, softwarové balíčky, základní principy.
  • (2) Biologické časopisecké a elektronické databáze na WWW. Vyhledávání informací na WWW. Práce s odbornými literárními zdroji (vyhledávání, třídění, tvorba výstupů) – praktické operace využitelné při tvorbě seminárních, diplomových, doktorských prací, prezentací, blogů apod.
  • (3) Zásady importu experimentálních hromadných dat do PC, základy jednoduchého matematicko-statistického zpracování, tvorba grafů, základní statistika.
  • (4) Pokročilé možnosti využití tabulkového procesoru Excel při zpracování experimentálních dat.
  • (5) Analýza obrazu – praktické cvičení demonstrující možnosti využití při aplikaci analýz biologických objeků.
  • (6) Využití PC v mikroskopii (optická mikroskopie, skenovací elektronová mikroskopie, fluorescenční techniky, moderní a pokročilé metody).
  • (7) Grafické databáze a jejich využití v analýze ekosystémů (elektronické mapy, satelitní snímky, interaktivní mapy, geografické informační systémy, on line sledovací systémy, live web kamery).
  • (8) Základy tvorby odborné prezentace : Praktické cvičení zaměřené na tvorbu prezentace v PowerPoint-u. Možnosti software, často opakované chyby, multimediální pezentace, animace, začlenění zvukové stopy, videa. Tvorba schémat, grafických struktur. Několik užitečných triků jak upoutat pozornost posluchačů.
  • (9) Využití PC ve specializovaných biologických oborech: Bioarcheologie, analýza biologických vzorků, palynologické databáze a software (analýza pylu), rekonstrukce kosterních zbytků, 3D modely využité při rekonstrukcích lebky – praktické cvičení.
  • (10) Využití PC ve specializovaných biologických oborech: Systematická botanika a zoologie. Porovnávací metody (elektronické scanovací metody), mapové aplikace pro studie areálů, biodiverzity, elektronické archivy (e-herbáře).
  • (11) Využití PC ve specializovaných biologických oborech: Experimentální biologické discipliny: biofyzikální a biochemické metody studia organismů na různých úrovních (membrána, buněčné struktury… až… ekosystém). Modely, expertní systémy, monitorovací systémy, studium závislostí biologických procesů na biotických a abiotických faktorech.
  • (12) Využití PC ve specializovaných biologických oborech: Molekulární biologie a genetika. Sekvenování, genetické databáze, metody studia genomu.
  • (13) E-learning, Počítačem podporovaná výuka biologie: Interaktivní databáze a web servery, self-evaluation methods – testování znalostí. Kombinované databáze - slovníky, encyklopedie, mutimedia.
Literatura
  • Suitable literature is recommended by the teacher during the course run.
  • Vhodná literatura je doporučena vyučujícími v průběhu cvičení.
Výukové metody
(1) Samostatná cvičení dle individuálního zadání plněná studenty v rámci výuky na PC. (2) Práce na PC projektového typu (plnění zadání s určenou dobou dostupnou pro vypracování (zpravidla 2-3 týdny)
Metody hodnocení
Výuka i zápočet probíhají formou řešení úkolů (konkrétních zadání) na počítači. Doplňkové informace o charakteru výuky lze získat na níže uvedené web stránce (dosud je tvořena, její dokončení: 1.10.2009)
Informace učitele
http://www.sci.muni.cz/kfar/old/pcbio.html
Předmět je určen studentům širokého spektra biologických oborů, především však těch, ve kterých se pracuje experimentálně. Početní limit studentů tohoto předmětu je 26 osob. V případě překročení tohoto limitu maji přednost studenti specializace Fyziologie rostlin, ostatní pak dle pořadí zápisu.
Další komentáře
Poznámka k ukončení předmětu: Zápočet = splnění úlohy (konkrétního zadání) na PC
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020.