IB023 Binding and Kinetics for Experimental Biologists

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011 - akreditace

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
2/0. 1D. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Petr Kuzmic, Ph.D. (přednášející), doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (zástupce)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Osnova
  • LECTURE TOPICS 1. Principles of data analysis: Matching models to experimental data 2. Confidence intervals for rate and equilibrium constants 3. Time course of biochemical and biophysical processes: Mathematical models 4. Experimental methods for the determination of rate constants 5. Biochemical and biophysical equilibria: Mathematical models 6. Analysis of equilibrium binding data 7. Enzyme catalysis and inhibition of enzymes 8. Choosing the appropriate molecular mechanism based on available data Notes: • All lectures will include concrete examples from published literature
  • EXERCISES 1. Determination of a equilibrium binding constant for a protein-protein or protein-DNA interaction 2. Determination of rate constants for protein-ligand interaction 3. Determination of stoichiometry protein-ligand interaction 4. Selecting an appropriate mechanism for enzyme inhibition Notes: • Practical sessions will be held in the computer laboratory using the software DynaFit • All exercises will include actual data published in the literature • Students are encouraged to bring their own additional data
Vyučovací jazyk
Angličtina
Informace učitele
Intensive lecture course with practical PC sessions.
Další komentáře
Předmět je vyučován jednorázově.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: Výuka probíhá blokově 22.-26.11.2010.
http://www.biokin.com/dynafit/index.html.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2010.