Bi7690c Molekulární diagnostika vrozených poruch - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011
Rozsah
0/1. 1 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: z. Jiná možná ukončení: kz.
Vyučující
doc. RNDr. Lenka Fajkusová, CSc. (cvičící)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Lenka Fajkusová, CSc.
Rozvrh
Út 9:00–10:50 Kontaktujte učitele
Předpoklady
( Bi4020 Molekulární biologie || Bi4010 Základy molekulární biologie ) && NOW( Bi7690 Mol. diagnostika vroz. poruch )
Základní znalosti molekulární biologie a biochemie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Mateřské obory/plány
předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem cvičení je získání teoretických a hlavně praktických zkušeností v oblasti molekulární genetické diagnostiky. Konkrétně se studenti seznámí s metodami souvisejícími s detekcí mutací menšího rozsahu (polymerázová řetězová reakce, sekvenční analýza, fragmentační analýza) a metodami pro detekci rozsáhlých genových přeuspořádání (multiple ligation dependent probe amplification, MLPA). V rámci cvičení získají studenti zkušenosti i s použitím počítačových programů pro vyhodnocování sekvenčních analýz (Mutation surveyour) a MLPA (Coffalyser).
Osnova
  • 1) Seznámení s náplní kurzu
  • 2) PCR
  • 3) PCR a sekvenční analýza DNA
  • 4) Vyhodnocení sekvenční analýzy pomocí programu Mutation surveyour
  • 5) Fragmentační analýza
  • 6) Vyhodnocení fragmentační analýzy
  • 7) MLPA
  • 8) Vyhodnocení MLPA pomocí programu Coffalyser.
Literatura
  • materiály ke cvičení budou studentům dodány
Výukové metody
Teoretická příprava a laboratorní cvičení
Metody hodnocení
Odevzdání protokolů z jednotlivých cvičení.
Informace učitele
Spolu s předmětem Bi7690c je vhodné absolvovat (nebo mít absolvovaný) předmět Bi7690.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2010, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012.