PřF:Bi7910 Metody environ. mikrobiologie - Informace o předmětu
Bi7910 Metody environmentální mikrobiologie
Přírodovědecká fakultapodzim 2011
- Rozsah
- 2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
- Vyučující
- doc. Ing. Martin Krsek, CSc., MSc (přednášející)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník) - Garance
- prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Martin Krsek, CSc., MSc - Předpoklady
- Bi8555 Environ. mikrobiol.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
- Mateřské obory/plány
- Obecná biologie (program PřF, N-BI)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
- Cíle předmětu
- Cílem předmětu je seznámit posluchače s metodami používanými v environmentální mikrobiologii s důrazem na nejnovější molekulární metody.
- Osnova
- Úvod, metody odběru a zpracování environmentálních vzorků z různých prostředí, detekce mikroorganismů v půdě, izolace mikroorganismů, stanovení biomasy, detekce mikrobiální aktivity, metody izolace mikrobiální R/DNA, tvorba metagenomových knihoven, určení diverzity mikrobiálních společenstev, využití metod PLFA a FAME ve studiu diverzity mikrobiálních společenstev, fingerprintové metody v environmentální mikrobiologii (T/DGGE, SSCP, LH-PCR, T-RFLP), metoda reasociace environmetální DNA, využití metagenomových knihoven a pyrosekvenování v environmentální mikrobiologii, izotopové metody a jejich využití a význam, chromatografick metody (plynová a kapalinová chromatografie) v environmetální mikrobiologii.
- Literatura
- doporučená literatura
- Methods for Studying the Ecology of soil Micro-organisms, D Parkinson, TRG Gray, ST Williams, Blackwell Scientific Publications, 1971
- Environmental microbiology :current technology and water applications. Edited by Keya Sen. Norfolk: Caister Academic Press, 2011. ISBN 9781904455707. info
- PEPPER, Ian L. a Charles P. GERBA. Environmental microbiology : a laboratory manual. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2004, xvii, 209. ISBN 0125506562. info
- BITTON, Gabriel. Encyclopedia of environmental microbiology. New York, N.Y.: John Wiley & Sons, 2002, vi, 577-11. ISBN 0471360473. info
- Výukové metody
- přednáška
- Metody hodnocení
- Aktivní účast na přednáškách, závěrečná ústní zkouška
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2011/Bi7910