C7880 Separační metody II

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Oldřich Janiczek, CSc. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
( C4182 Biochemie II || C3580 Biochemie ) && ( C6200 Biochemické metody || C6260 Metody separace proteinů || C4830 Instrumentální biochem. metody )
Základní znalosti z přednášky z obecné biochemie a metod chemického abiochemického výzkumu.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem této přednášky je, aby studenti získali znalosti o separačních metodách využívaných v biochemii a molekulární biologii při separaci makromolekul (proteinů, nukleových kyselin). První část je věnována elektromigračním metodám. Druhá část je věnována chromatografickým metodám a třetí část Field Flow Fractionaci, superkritické fluidní chromatografii a hmotové spektroskopii.
Osnova
  • A.Elektromigrační metody 1. Úvod do elektromigračních metod
  • 2. Kapilární zónová elektroforéza
  • 3. Izotachoforéza
  • 4. Afinitní elektroforéza
  • 5. Detekce bílkovin po elektroforéze
  • 6. Blotting
  • 8. Elektroforéza nukleových kyselin
  • B.Field Flow Fractionation
  • C.Chromatografické metody
  • 1. Mikrokolonová kapalinová chromatografie
  • 2. Plynová chromatografie a GC MS
  • 3. Superkritická fluidní chromatografie a extrakce
  • D. Hmotová spectrometrie
  • E. Aplikace afinitních interakcí při purifikaci bílkovin
Literatura
  • SNYDER, Lloyd R., Joseph Jack KIRKLAND a Joseph L. GLAJCH. Practical HPLC method development [Snyder, 1997]. 2nd ed. New York: John Wiley & Sons, 1997, xxvi, 765. ISBN 0-471-00703-X. info
  • KITSON, F. G., B. S. LARSEN a C. N. MCEWEN. Gas Chromatography and Mass Spectrometry, A Practical Guide. San Diego: Academic Press, 1996. ISBN 0-12-483385-3. info
  • WEISS, Joachim. Ion chromatography. 2nd ed. Weinheim: VCH Verlagsgesellschaft, 1995, 465 s. ISBN 3-527-28698-5. info
  • ROTHE, Gunter M. Electrophoresis of enzymes : laboratory methods. Berlin: Springer-Verlag, 1994, 307 s. ISBN 3540581146. info
  • Handbook of capillary electrophoresis. Boca Raton: CRC Press, 1994, 649 s. ISBN 0-8493-8690-X. info
  • Protein blotting : a practical approach. Edited by Bonnie S. Dunbar. Oxford: Oxford University Press, 1994, 242 s. ISBN 0199634378. info
  • KUHN, Reinhard a Sabrina HOFFSTETTER-KUHN. Capillary electrophoresis : principles and practice. Berlin: Springer-Verlag, 1993, x, 375 s. ISBN 3-540-56434-9-. info
  • LI, Sam F. Y. Capillary electrophoresis : principles, practice and applications. Amsterdam: Elsevier, 1993, 582 s. ISBN 0444815902. info
  • FORET, František, Ludmila KŘIVÁNKOVÁ a Petr BOČEK. Capillary zone electrophoresis. Weinheim: VCH Publishers, 1993, 346 s. ISBN 3-527-30019-8. info
  • LINDSAY, Sandie. High performance liquid chromatography. 2nd ed. Chichester: John Wiley & Sons, 1992, xxii, 337. ISBN 0-471-93180-2. info
  • ANDREWS, Anthony T. Electrophoresis : theory, techniques and biochemical and clinical applications. 1st pub. Oxford: Clarendon Press, 1990, xv, 452 s. ISBN 0-19-854632-7. info
  • Gel electrophoresis of proteins : a practical approach. Edited by B. D. Hames - D. Rickwood. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1990, xviii, 383. ISBN 0199630755. info
  • High performance liquid chromatography in biotechnology. Edited by William S. Hancock. New York: John Wiley & Sons, 1990, 564 s. ISBN 0471825840. info
  • MIKEŠ, O. High-performance liquid chromatography of biopolymers and biooligomers. P. B, separation of individual compound classes. Amsterdam: Elsevier, 1988, 721 s. ISBN 0444430342. info
Výukové metody
Dvouhodinové přednášky budou prezentovány interními a externími specialisty pro dané oblasti.
Metody hodnocení
Zkouška probíhá písemnou formou. Studenti dostávají test zahrnující otázky z přednášených technik separace makromolekul. Doba testu je 1 hodina. Klasifikace je A-F respektive "prospěl" nebo "neprospěl". Zkoušející doc. Janiczek.
Informace učitele
http://orion.chemi.muni.cz/biochem/student.htm
Na přednáškách se podílí přední odborníci z Ústavu analytické a instrumentální chemie AV ČR a Biofyzikálního ústavu AV ČR.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován jednou za dva roky.
Poznámka k periodicitě výuky: (liché roky).
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 1999, podzim 2000, podzim 2001, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2011 - akreditace, podzim 2014, podzim 2016, podzim 2018, podzim 2020, podzim 2022, podzim 2024.