PřF:Bi9061 Bioinformatika - cvičení - Informace o předmětu
Bi9061 Bioinformatika - cvičení
Přírodovědecká fakultapodzim 2012
- Rozsah
- 0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
- Vyučující
- prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Eva Šebestová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník) - Garance
- prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh seminárních/paralelních skupin
- Bi9061/01: Čt 10:00–11:50 B09/316, J. Damborský, R. Pantůček, E. Šebestová
Bi9061/02: Čt 12:00–13:50 B09/316, J. Damborský, R. Pantůček, E. Šebestová
Bi9061/03: Čt 16:00–17:50 B09/316, J. Damborský, R. Pantůček, E. Šebestová - Předpoklady
- NOW( Bi9060 Bioinformatika II ) || NOW( Bi5000 Bioinformatika I ) && ! C9081 Bioinformatics - practice
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 70 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/70, pouze zareg.: 0/70, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/70 - Mateřské obory/plány
- Analytická biochemie (program PřF, N-BCH)
- Biochemie (program PřF, N-BCH)
- Biochemie (program PřF, N-CH)
- Buněčná a molekulární diagnostika (program PřF, B-BI)
- Matematická biologie (program PřF, B-BI)
- Matematická biologie (program PřF, B-EXB)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-BI)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB, směr Antropogenetika)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Cíle předmětu
- Studenti si osvojí práci s řadou bioinformatických databází a nástrojů, které jsou běžně využívány v rámci biologického a biochemického výzkumu.
- Osnova
- 1. Bioinformatické databáze
- 2. Manipulace se sekvenčními daty
- 3. Návrh primerů a restrikční analýza
- 4. Párové sekvenční přiložení
- 5. Mnohonásobné sekvenční přiložení
- 6. Hledání a identifikace genů
- 7. Analýza proteinových sekvencí
- 8. Anotace nukleotidové sekvence pro zaslání do databáze
- 9. Strukturní databáze
- 10. Předpověď struktury proteinů
- Literatura
- doporučená literatura
- CLAVERIE, Jean-Michel a Cedric NOTREDAME. Bioinformatics for dummies. 2nd ed. Hoboken, N.J.: Wiley, 2007, xviii, 436. ISBN 9780470089859. info
- Výukové metody
- cvičení v počítačové učebně
- Metody hodnocení
- Písemný test - řešení praktických úkolů
- Informace učitele
- http://loschmidt.chemi.muni.cz/bioinf
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně. - Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Bi5000c Bioinformatika - cvičení
Bi5000 || NOW(Bi5000) && !Bi9061
- Bi5000c Bioinformatika - cvičení
- Statistika zápisu (podzim 2012, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2012/Bi9061