PřF:Bi9061 Bioinformatika - cvičení - Informace o předmětu
Bi9061 Bioinformatika - cvičení
Přírodovědecká fakultapodzim 2013
- Rozsah
- 0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
- Vyučující
- prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. David Bednář, Ph.D. (cvičící)
Koen Beerens, PhD. (cvičící)
Mgr. Jan Brezovský, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)
Mgr. Lukáš Daniel, Ph.D. (cvičící)
Dr. Shubhangi Kaushik (cvičící)
Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník) - Garance
- prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh seminárních/paralelních skupin
- Bi9061/01: Po 16. 9. až Pá 6. 12. Út 7:00–8:50 B09/316, R. Pantůček, E. Šebestová
Bi9061/02: Po 16. 9. až Pá 6. 12. Út 9:00–10:50 B09/316, R. Pantůček, E. Šebestová
Bi9061/03: Po 16. 9. až Pá 6. 12. Út 11:00–12:50 B09/316, R. Pantůček, E. Šebestová - Předpoklady
- NOW( Bi9060 Bioinformatika II ) || NOW( Bi5000 Bioinformatika I ) && ! C9081 Bioinformatics - practice
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 70 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/70, pouze zareg.: 0/70, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/70 - Mateřské obory/plány
- předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Studenti si osvojí práci s řadou bioinformatických databází a nástrojů, které jsou běžně využívány v rámci biologického a biochemického výzkumu.
- Osnova
- 1. Bioinformatické databáze
- 2. Manipulace se sekvenčními daty
- 3. Návrh primerů a restrikční analýza
- 4. Párové sekvenční přiložení
- 5. Mnohonásobné sekvenční přiložení
- 6. Hledání a identifikace genů
- 7. Analýza proteinových sekvencí
- 8. Anotace nukleotidové sekvence pro zaslání do databáze
- 9. Strukturní databáze
- 10. Předpověď struktury proteinů
- Literatura
- doporučená literatura
- CLAVERIE, Jean-Michel a Cedric NOTREDAME. Bioinformatics for dummies. 2nd ed. Hoboken, N.J.: Wiley, 2007, xviii, 436. ISBN 9780470089859. info
- Výukové metody
- cvičení v počítačové učebně
- Metody hodnocení
- Písemný test - řešení praktických úkolů
- Informace učitele
- http://loschmidt.chemi.muni.cz/bioinf
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně. - Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Bi5000c Bioinformatika - cvičení
Bi5000 || NOW(Bi5000) && !Bi9061
- Bi5000c Bioinformatika - cvičení
- Statistika zápisu (podzim 2013, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2013/Bi9061