Bi5599 Aplikovaná chemie a biochemie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2013
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.
Vyučující
prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Alois Kozubík, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Čt 9:00–10:50 BFU
Předpoklady
Bi4020 Molekulární biologie && C3580 Biochemie
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Na předmět se vztahuje povinnost registrace, bez registrace může být znemožněn zápis předmětu!
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Na konci tohoto kursu by měli být studenti schopni porozumět významu jednotlivých vyučovaných chemických a biochemických metodik a interpretovat svá vlastní experimentální data. Měli by být schopni využít informace primární literatury, s cílem porozumět a zavádět metodiky popisované v primární vědecké literatuře v oblasti fyziologie živočichů a molekulární fyziologie. Studenti by měli být schopni předkládat argumentačně promyšlená rozhodnutí o významu dat a interpretovat jejich biologický význam. Na základě těchto předpokladů by měli být schopni prezentovat a objasnit metodiky, využívané v jejich vlastní práci, odbornému publiku.
Osnova
  • 1)Analýza proteinů separační techniky, Western blotting, proteinové interakce, modifikace proteinů, lokalizace proteinů, proteomika, manipulace exprese proteinů.
  • 2)Základní imunochemické techniky.
  • 3)DNA izolace, separace, PCR techniky, práce s plazmidy, transfekce eukaryotických buněk.
  • 4)RNA izolace, detekce (Northern blotting, RT-PCR), microarrays, siRNA
  • 5)Lipidy a polysacharidy; izolace, separace a identifikace.
  • 6)Nízkomolekulární látky separační a analytické techniky, HPLC techniky a modifikace.
  • 7)Specifické buněčné testy.
  • 8)Fluorescenční techniky.
  • 9)Aplikace in vivo modelů savců ve fyziologii
Literatura
  • Klouda, Moderní analytické metody, Pavel Klouda, Ostrava, 2003
  • Alberts et al.: Molecular Biology of the Cell, 4th ed., Garland Science, 2002
  • Wilson et al.: Principles and Techniques of Practical Biochemistry, 5th ed., CUP, 2000
Výukové metody
přednášky, seminář
Metody hodnocení
Přednáškový cyklus je ukončen formou kolokvia. Ukončení je provedeno formou referátu (10 minut) o metodických přístupech využitých v zadané vědecké publikaci (separátu). Studenti ve své prezentaci sumarizují základní východiska a závěry referované vědecké publikace, a podrobně komentují metodiku - konkrétní metodu zadává vyučující. Závěrečné hodnocení je dáno kvalitou prezentace a po diskusi s přednášejícími.
Další komentáře
Studijní materiály
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.