C8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2014
Rozsah
0/2. blok 5 dnů. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: kz. Jiná možná ukončení: z.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
C8980 Exprese a purifikace proteinů
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie. Student musí před cvičením absolvovat předmět C8980 Exprese a purifikace proteinů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 19 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Student po absolvování cvičení zná základní praktické poznatky jak exprimovat a purifikovat rekombinantní proteiny, má zkušenosti s různými expresními systémy a umí použít různé purifikační metody. Během kurzu se student seznámil s různými metodami detekce a je schopen značit proteiny pro NMR analýzu nebo krystalografii.
Osnova
  • 1. Strategie klonování do expresních plasmidů. 2. Exprese a purifikace scFv produkovaných do cytoplasmy nebo do periplasmatického prostoru. 3. Exprese a purifikace rostlinných proteinů (A. pET32 – thioredoxin - chaperon/B. pRSET – His.tag/ C. pET161DEST – Gate way technologie – Lumio.tag/D. pET28 – bez kotvičky.)
Literatura
    doporučená literatura
  • PRICE, Nicholas C. a Jacqueline NAIRN. Exploring proteins : a student's guide to experimental skills and methods. Oxford: Oxford University Press, 2009, xv, 512. ISBN 9780199205707. info
    neurčeno
  • Protein purification : principles, high resolution methods, and applications. Edited by Jan-Christer Janson. 3rd ed. Hoboken, N.J.: John Wiley & Sons, 2011, xiv, 517. ISBN 9780471746614. info
  • HARDIN, Charles. Cloning, gene expression and protein purification : experimental procedures and process rationale. New York: Oxford University Press, 2001, viii, 435. ISBN 0195132947. info
  • Guide to protein purification. Edited by Richard R. Burgess - Murray P. Deutscher. 2nd ed. Boston: Elsevier/Academic Press, 2009, liii, 851. ISBN 9780123749789. info
Výukové metody
Hlavní výukovou metodou je laboratorní cvičení, které navazuje na přednáškový cyklus předmětu s názvem Exprese a purifikace proteinu (C8980).
Metody hodnocení
Předmět je úspěšně ukončen po absolvování blokového cvičení a odevzdáním laboratorních protokolů, které byly schváleny vyučujícím.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2012, podzim 2013, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.