Bi7893 Seminář Loschmidtových laboratoří

Přírodovědecká fakulta
podzim 2015
Rozsah
0/2. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jan Brezovský, Ph.D. (cvičící)
Koen Beerens, PhD. (cvičící)
Dr. Shubhangi Kaushik (cvičící)
Garance
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Pá 8:30–10:30 C13/332
Předpoklady
Completion of basic courses of biochemistry and/or molecular biology is a prerequisite for subscription to the course. ability to communicate in English
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Jiné omezení: urceno pro skupinu Loschmidtových laboratoří
Cíle předmětu
V rámci odborného semináře "Loschmidtových laboratoří" se studenti seznámí s různými aspekty výzkumu a vývoje zaměřeného na konstrukci proteinů metodami racionálního designu a řízené evoluce. Na semináři jsou diskutovány teoretické a experimentální problémy proteinového inženýrství včetně transferu výsledků výzkumu do praxe. Mikrobiálni enzymy halogenalkandehalogenasy slouží jako modelový systém pro demonstraci různých strategií používaných v proteinovém inženýrství. Studenti týdně referují o průběhu řešení samostatného výzkumného projektu. Učí se přednášet odbornou tématiku vlastní vědecké práce i výsledky publikované v odborných časopisech formou "Journal Clubs". Studenti jsou systematicky vedeni ke kritickému hodnocení obsahové a formální stránky prezentací. Na semináři jsou rovněž informováni o nejnovějších poznatcích v oboru prezentovaných na odborných konferencích a sami referují o zkušenostech ze setkání, kterých se v průběhu roku zúčastnili. V rámci semináře studenti získávají první zkušenosti s vedením odborných seminářů a přípravou zápisů z jednání.
Osnova
  • * Screening of New Proteins by Bioinformatic Analysis * Rational Design of Proteins by Computer Modelling * Construction of Modified Proteins by Site-Directed Mutagenesis and Directed Evolution * Characterization of Modified Proteins by Biochemical and Biophysical Techniques
Literatura
  • Protein Structure and Function, Gregory A. Petsko, Dagmar Ringe, New Science Press, 2004 ISBN 1405119225, 9781405119221, str. 195
Výukové metody
The lecture is taught by interpretation of powerpoint templates prepared according to textbooks, monographs and articles. Templates are shown during the lecture, the contents are explained and accompanied by teacher commentary.
Metody hodnocení
zápočet
Další komentáře
Předmět je vyučován každý semestr.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2011, jaro 2012, podzim 2012, jaro 2013, podzim 2013, jaro 2014, podzim 2014, jaro 2015, jaro 2016, podzim 2016, jaro 2017, podzim 2017, jaro 2018, podzim 2018, jaro 2019, podzim 2019, jaro 2020, podzim 2020, jaro 2021, podzim 2021, jaro 2022, podzim 2022, jaro 2023, podzim 2023, jaro 2024, podzim 2024, jaro 2025.