PřF:C7350 MS proteinů - cvičení - Informace o předmětu

C7350 Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií - cvičení

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Pá 8:00–9:50 C02/121

Předpoklady

NOW( C7250 Charakterizace proteinů MS )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Analytická biochemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
• Analytická biochemie (program PřF, N-BCH)
• Analytická chemie (program PřF, N-CH)
• Bioanalytik - odborný pracovník v laboratorních metodách (program PřF, N-BCH)
• Biofyzika (program PřF, D-FY4)
• Biofyzika (program PřF, N-FY)
• Biochemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
• Biochemie (program PřF, D-BCH4)
• Biochemie (program PřF, N-BCH)
• Biomolekulární chemie (program PřF, D-BCH4) (2)
• Biomolekulární chemie (program PřF, N-BCH)
• Bio-omika (angl.) (program PřF, D-VZP) (2)
• Bio-omika (program PřF, D-VZP) (2)
• Genomika a proteomika (angl.) (program PřF, D-BCH4) (2)
• Genomika a proteomika (angl.) (program PřF, N-BCH)
• Genomika a proteomika (program PřF, D-BCH4) (2)
• Genomika a proteomika (program PřF, N-BCH)
• Mikrobiologie (program PřF, D-BI4)
• Molekulární a buněčná biologie (program PřF, D-BI4)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
• Obecná a molekulární genetika (program PřF, D-BI4)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Ekotoxikologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie rostlin)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je vysvětlit studentům principy metod pro identifikaci proteinů pomocí MS a MS/MS dat, praktické použití vhodných prohledávacích programů pro identifikaci proteinů a základy interpretace MS/MS spekter.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět základům identifikace proteinů pomocí MS a MS/MS dat;
vybrat a používat vhodný prohledávací program pro identifikaci proteinů;
porozumět základům interpretace MS/MS spekter.

Osnova

• Interpretace MS dat;
• Interpretace MALDI-MS/MS a ESI-MS/MS dat;
• Identifikace proteinů pomocí MS a MS/MS dat;
• Úvod do de-novo sekvenování;
• Charakterizace modifikací proteinů - určení druhu a místa;

Literatura

doporučená literatura
• SNYDER, Peter A. Interpreting protein mass spectra :a comprehensive resource. Oxford: Oxford University Press, 2000, xi, 522 s. ISBN 0-8412-3571-6. info

Výukové metody

praktická cvičení na počítači

Metody hodnocení

individuální zpracování modelových dat

Informace učitele

Cvičení se střídá s přednáškou (C7250). Začínáme dvěma přednáškami, Cvičení bude probíhat v mistnosti C02/1.21. Termíny budou upřesněny.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (podzim 2022, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2022/C7350