Bi4030 Úvod do metod molekulární biologie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2023
Rozsah
1/0/0. 1 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: k.
Vyučující
Mgr. Tibor Botka, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi4030/01: Po 17:00–18:50 B11/305, T. Botka
Bi4030/02: Po 17:00–18:50 B11/305, T. Botka
Předpoklady
! Bi4010c Základy molekul. biologie sem. && NOW( Bi4030c Molekulární biologie - cv. )
Základní znalosti obecné genetiky, mikrobiologie, anorganické chemie, organické chemie a biochemie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Úvod do metod molekulární biologie, které se provádějí v příslušném praktiku. Po absolvování předmětu by studenti měli znát principy metod izolace a analýzy genetického materiálu jako je plazmidová i chromozomální DNA či klonování.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen popsat principy molekulárně biologických metod: izolace plazmidové DNA; spektrofotometrie; refraktometrie; ultracentrifugace; štěpení restrikčními endonukleázami, elektroforetické separační metody; PCR; klonování vč. ligace a transformace; přístupy k selekci transformantů.
Osnova
  • 1. Význam a příprava roztoků používaných v molekulární biologii. 2. Izolace plazmidového vektoru a Stanovení čistoty a koncentrace DNA. 3. Štěpení DNA restrikčními endonukleázami a horizontální gelová elektroforéza. 4. Konstrukce restrikční mapy, izolace DNA z gelů. 5. Klonování v plazmidových vektorech, transformace, selekce klonů. 6. Ultracentrifugace. 7. Izolace bakteriální (genomové) DNA pro DNA fingerprinting. 8. PCR (polymerázová řetězová reakce) a její modifikace PCR-RFLP, AP-PCR.
Literatura
  • Methods in molecular biology. Totowa: Humana Press. info
  • SAMBROOK, Joseph, Edward F. FRITSCH a Tom MANIATIS. Molecular cloning : a laboratory manual. 2nd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989, s. v-xxxii. ISBN 0879693096. info
Výukové metody
Teoretická příprava na základě výkladu a prezentací.
Metody hodnocení
Vypracování samostatných úloh v průběhu semestru a složení písemného testu obsahujícího 20 otázek (max. 50 bodů).
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2022, podzim 2024.