Bi6700c Taxonomie prokaryot - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2024
Rozsah
0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
Mgr. Dana Nováková, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
NOW( Bi6700 Taxonomie prokar. )
Zkouška z obecné mikrobioloige, fyziologie bakterií, biochemie, molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Jiné omezení: Limitujici je kapacita cvicebny
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem tohoto kurzu je seznámit studenty s izolaci a kultivaci mikroorganizmů a uchovávání čistých kultur. Dále se stanovením morfologie archaeí i bakterií, jejich fenotypovou klasifikaci a diagnostiku a typizaci a identifikaci bakterií metodou rep-PCR i hmotnostní spektrometrií MALDI TOF.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu bude student schopen samostatně provést: - izolaci a kultivaci mikroorganizmů, uchovávání čistých kultur; - mikroskopickou a makroskopickou morfologie archaeí i bakterií; - fenotypovou klasifikaci a diagnostiku gramnegativních bakterií; - fenotypovou klasifikaci a diagnostiku grampozitivních bakterií; - typizaci a identifikaci bakterií metodou rep-PCR; - analýzu mikroorganizmů hmotnostní spektrometrií MALDI TOF.
Osnova
  • Pevná a tekutá média
  • Izolace
  • Kultivace
  • Morfologie
  • Klasifikace fermentujících tyček
  • Klasifikace nefermentujících tyček
  • Klasifikace G+ koků a tyček (kmeny Actinobacteria, Firmicutes)
  • rep_PCR
  • MALDI TOF MS
  • Zhodnocení identifikace
Literatura
    povinná literatura
  • SEDLÁČEK, Ivo. Taxonomie prokaryot. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2007, 270 s. 55-969C-2006 02/58 12Př. ISBN 80-210-4207-9. info
    doporučená literatura
  • Murray, PB., Baron, E.J., Jorgensen, J.H., Pfaller, M.A., Yolken, R.H. (eds.). 2003. Manual of clinical microbioloogy. Volume 1. 8th edition. ASM Press. Washington, D.C.
  • Pershing, D.H., Tenover, F.C., Versalovic, J., Tang, Y.W., Unger, E.R., Relman, D.A., White, TJ. (eds.). 2004. Molecular microbiology: diagnostic principles and practice. ASM Press, Washington, USA.
Výukové metody
Teoretická příprava a na ni navazující laboratorní cvičení.
Metody hodnocení
Dva písemné testy pro připuštění ke cvičením (30 a 50 otázek), praktické cvičení, zápočet.
Navazující předměty
Informace učitele
Cvičení je určeno pouze pro studenty PřF MU zaměření mikrobiologie.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/Bi6700c