CORE075 Do světa biomolekul

Přírodovědecká fakulta
podzim 2024
Rozsah
2/0/0. 3 kr. Ukončení: k.
Vyučující
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Jan Havliš, Dr. (přednášející)
doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Josef Houser, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 15:00–16:50 B11/335
Předpoklady
!TYP_STUDIA(ND) && !FORMA(C) && (!PROGRAM(B-UCB) && !PROGRAM(B-UCC) && !PROGRAM(B-UCF) && !PROGRAM(B-UCM) && !PROGRAM(B-UCZ) && !PROGRAM(B-LGM) && !PROGRAM(B-BIC) && !PROGRAM(B-CHE) && !PROGRAM(B-CKR) && !PROGRAM(B-ZPZ))
Zájem o povahu živého světa.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
Kurz Do světa biomolekul je určen všem, kdo se zajímají o povahu živého světa, bez ohledu na aktuální studijní obor. A protože molekuly (nukleové kyseliny, bílkoviny, sacharidy, lipidy i mnohé další) dělají v buňkách prakticky vše, předsevzali jsme si seznámit studenty s těmi oblastmi poznání, které se týkají molekulové povahy života. Jaké molekuly a proč se vyskytují v buňkách? Jak se o nich vše dozvídáme? Jaký je pravděpodobný původ těchto molekul? Jednotlivé přednášky si berou za cíl formou odpovědí na obecnější otázky prezentovat vždy ucelené téma, a to snadno stravitelnou formou, s důrazem na srozumitelnost i utříděný obsah. Kurz přináší vhled a orientaci do důležitých témat, která i přes svou zdánlivou odtažitost významně ovlivňují naše každodenní životy, například prostřednictvím medicíny či moderních (bio)technologií.
Výstupy z učení
Studenti se seznámí se základními aspekty molekulové povahy živého světa a seznámí se se současným stavem a trendy na tomto poli poznání. Dozví se o významu znalostí těchto poznatků pro další oblasti nejen bádání, ale i praktického využití.
Osnova
  • Co to je? I - Úvod o molekulách tvořících buňku, centrální dogma, proteiny, genomika (Jiří Fajkus)
  • Čím to drží pohromadě? O interakcích v biomolekulách a mezi biomolekulami, úvod o termodynamice pro laiky (Lukáš Žídek)
  • Co to je? II Cukry a lipidy (Lenka Malinovská)
  • Jak to asi vzniklo? Původ a vznik života (Jan Havliš)
  • Proč je to dobré znát? Molekulární původ vybraných nemocí, molekulární medicína (Michaela Wimmerová)
  • Jak to můžeme číst? Principy sekvenací, PCR a Sanger, qPCR, genomika (Miloslava Fojtová)
  • Odkud víme, kdo s kým? Metody měření intermolekulárních interakcí (Ctirad Hofr)
  • Proč to nemůžeme vidět? Vysvětlení omezeného rozlišení optické mikroskopie, úvod k úvahám o vlnách (Lukáš Žídek)
  • Jak to můžeme vidět? Úvod do struktury biomolekul a krystalografie (Josef Houser)
  • Co s tím má společného Einstein? Ukázka toho, že zdánlivě odtažitá fyzika je základem stěžejních metod (kvantová fyzika – vlnový charakter elektronu-elektronový mikroskop; teorie relativity – spin – NMR) (Lukáš Žídek)
  • Jak se v tom můžeme vyznat? Bioinformatika (Lenka Malinovská)
  • „Můžeme to spočítat? Výpočetní metody, MD simulace, AlphaFold (Petr Kulhánek)
Literatura
    doporučená literatura
  • Lane, Nick; Záhada života – proč je takový, jaký je? Dokořán / Argo 2022
    neurčeno
  • Essentials of Glycobiology, 4th edition; Cold Spring Harbor (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press; 2022. ISBN-13: 978-1-621824-21-3 (hardback); ISBN-13: 978-1-621824-22-0 (epub)
  • SNUSTAD, D. Peter a Michael J. SIMMONS. Genetika. Edited by Jiřina Relichová. 2. aktual. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2017, 864 s. ISBN 978-80-210-8613-5. info
  • FINKEL‘ŠTEJN, Aleksej Vital‘jevič a Oleg Borisovič PTICYN. Protein physics : a course of lectures. Second, updated and extended. Amsterdam: Elsevier, 2016, xx, 508. ISBN 9780128096765. info
  • MUKHERJEE, Siddhartha. Vládkyně všech nemocí. Příběh rakoviny. Překlad: Jan Šmarda. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2015, 520 s. Poprvé v češtině, sv. 3. ISBN 978-80-210-7761-4. Více informací o knize na stránkách Nakladatelství info
  • XIONG, Jin. Essential bioinformatics. 1st pub. Cambridge: Cambridge University Press, 2006, xi, 339. ISBN 0521600820. info
Výukové metody
Přednášky a diskuze.
Metody hodnocení
Studenti budou hodnoceni především na základě aktivní účasti na diskuzích, které budou na každé hodině pravidelnými součástmi kurzu. K absolvování kurzu bude potřeba 50 bodů, za aktivní účast na jedné hodině lze získat 5 bodů. Mimo aktivní účast na hodinách lze získat až 80 bodů v závěrečném jednovýběrovém testu.
Informace učitele
plán přednášek
16. 09. zahradní slavnost / riziko záplav a povodní


23. 09. Jiří Fajkus


30. 09. Lukáš Žídek


07. 10. Michaela Wimmerová


14. 10. Lenka Malinovská


21. 10. Jan Havliš


28. 10. státní svátek


04. 11. Miloslava Fojtová


11. 11. Ctirad Hofr


18. 11. Lukáš Žídek


25. 11. Josef Houser


02. 12. Lukáš Žídek


09. 12. Lenka Malinovská


16. 12. Petr Kulhánek

Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2023.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/CORE075